Mapas de ligadabilidad proteómica del fósforo (V) Las estereosondas identifican inhibidores TLCD1 covalentes

Área de la Ciencia:

• Biología Química
• Proteomía
• Metabolismo de los lípidos

Sus antecedentes:

• El perfil basado en la actividad de las proteínas (ABPP) permite el descubrimiento de ligandos covalentes para las proteínas.
• Las sondas definidas estereoisoméricamente ofrecen una mayor selectividad en ABPP.
• La función de muchas proteínas, incluida TLCD1, sigue siendo poco caracterizada.

Objetivo del estudio:

• Síntesis y caracterización de nuevas estereosondas con un grupo reactivo P(V) -oxatiafosfolano (OTP).
• Identificar las proteínas objetivo de las estereosondas OTP utilizando proteomía química.
• Esclarecer la función de TLCD1 y su inhibición por las estereosondas OTP.

Principales métodos:

• Síntesis de las estereosondas definidas estereoisoméricamente con P(V) -oxatiafosfolano (OTP).
• Perfiles basados en la actividad de las proteínas (ABPP) en células cancerosas humanas.
• Estudios de proteínas recombinantes, análisis lipidómico y predicción estructural de AlphaFold2.

Principales resultados:

• ABPP identificó numerosas proteínas con reactividad estereoselectiva hacia las estereosondas OTP.
• Las estereosondas OTP inhibían la TLCD1, lo que dificultaba la incorporación de ácidos grasos monoinsaturados a la fosfatidiletanolamina.
• TLCD1 comparte similitud estructural con las enzimas de procesamiento de lípidos y su histidina catalítica es crucial para la actividad.

Conclusiones:

• TLCD1 funciona como una aciltransferasa lipídica en las células humanas.
• Las estereosondas OTP actúan como inhibidores de la actividad enzimática de TLCD1.
• El análisis proteómico químico facilita la anotación funcional y la inhibición de las enzimas metabólicas de los lípidos.