La expansión in situ de la secuenciación del genoma vincula las anomalías nucleares con la regulación aberrante de la...

Área de la Ciencia:

• Biología celular
• La genómica
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• La microscopia y la genómica son claves para el análisis de la función celular.
• La conexión de estos tipos de datos, especialmente a resolución subnuclear, sigue siendo un desafío.

Objetivo del estudio:

• Introducir la expansión in situ de la secuenciación del genoma (ExIGS) para el análisis genómico y proteómico integrado.
• Investigar el vínculo entre las anomalías nucleares y la regulación génica en modelos de enfermedades.

Principales métodos:

• Se desarrolló la expansión de secuenciación del genoma in situ (ExIGS).
• Se aplicó ExIGS a fibroblastos derivados de progeria para la secuenciación del ADN y la localización de proteínas de superresolución.
• Se analizó la regulación de la cromatina y la distribución de las proteínas nucleares.

Principales resultados:

• ExIGS permite la secuenciación genómica simultánea y la localización de proteínas de súper resolución en células individuales.
• Las anomalías laminares en los fibroblastos de progeria se correlacionan con puntos calientes de regulación de la cromatina aberrantes.
• La lamina generalmente reprime la transcripción, con variaciones de la morfología nuclear que afectan la regulación génica.

Conclusiones:

• ExIGS es una plataforma versátil para vincular las anomalías nucleares con la regulación génica.
• Los hallazgos sugieren que los cambios en la morfología nuclear afectan la regulación genética en el envejecimiento y la enfermedad.
• El estudio proporciona información sobre los mecanismos de la enfermedad impulsados por anomalías nucleares.