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Updated: Sep 8, 2025

X-Ray Crystallography to Study the Oligomeric State Transition of the Thermotoga maritima M42 Aminopeptidase TmPep1050
Published on: May 13, 2020
Domando el tautomerismo en la predicción de la estructura cristalina orgánica
Cody J Perry1, Sebastian A Ramos1, Maria C Phelps1
1Department of Chemistry, University of California Riverside, Riverside, California 92521, United States.
Los modelos de teoría funcional de la densidad (DFT) predicen mal la energética polimórfica del cristal tautomérico, lo que afecta el desarrollo de la formulación de medicamentos. Un nuevo método híbrido DFT combinado con correcciones de la teoría de grupos acoplados mejora la precisión, revelando errores en el análisis de la estructura cristalina del mebendazol existente.
Área de la Ciencia:
- Química computacional
- Química del estado sólido
- Ciencias farmacéuticas
Sus antecedentes:
- El tautomerismo afecta significativamente las propiedades del fármaco como la solubilidad, la estabilidad, la eficacia y la toxicidad.
- El cribado computacional de la forma sólida ayuda a identificar las formulaciones de fármacos óptimas y a mitigar los riesgos de las formas cristalinas indeseables.
- La predicción precisa de la energía polimórfica del cristal tautomérico es crucial para el desarrollo de fármacos confiables.
Objetivo del estudio:
- Evaluar la precisión de los funcionales de densidad ampliamente utilizados en la predicción de la energética polimórfica de cristales tautoméricos.
- Investigar el impacto del error de deslocalización impulsado por la densidad en las predicciones de DFT.
- Desarrollar un método computacional mejorado para la predicción precisa de polimorfos tautoméricos.
Principales métodos:
- Aplicación de varios funcionales de densidad (DFT) para modelar polimorfos cristalinos tautoméricos.
- Análisis del error de deslocalización impulsado por la densidad en los cálculos de DFT.
- Desarrollo y aplicación de un enfoque híbrido de DFT combinado con correcciones de la teoría del clúster acoplado intramolecular (CC).
- Espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) de estado sólido para la validación experimental.
Principales resultados:
- Los modelos DFT estándar exhiben errores significativos en la predicción de las energéticas polimórficas tautoméricas, subestimando las barreras de tautomerización en estado sólido.
- Las diferencias de energía polimórfica tautomérica pueden exceder los 10 kJ/mol en ~40% de los casos, con errores DFT que alcanzan decenas de kJ/mol.
- El método híbrido DFT-CC refinado muestra un acuerdo sustancialmente mejorado con los datos experimentales.
- El estudio identificó un tautómero incorrecto en la estructura cristalina experimentalmente reportada de la forma B de mebendazol, confirmado por RMN en estado sólido.
Conclusiones:
- Los funcionales DFT ampliamente utilizados no son confiables para predecir las energéticas polimórficas de cristales tautoméricos debido a errores de deslocalización.
- La predicción precisa de los polimorfos tautoméricos requiere métodos computacionales avanzados, como el DFT híbrido con correcciones CC.
- Los hallazgos requieren una reevaluación de las predicciones computacionales para las formulaciones de fármacos que implican tautomerismo y resaltan los errores potenciales en las asignaciones de estructura cristalina existentes.
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