Mapeo espacial de alta resolución del estado celular y la dinámica del linaje in vivo con PEtracer

Área de la Ciencia:

• Biología celular
• Biología del desarrollo
• La genómica

Sus antecedentes:

• Comprender la determinación del destino celular es crucial para el desarrollo y la investigación de enfermedades.
• Los métodos de rastreo de linaje existentes tienen limitaciones en la resolución espacial y el perfil multimodal.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar PEtracer, una nueva tecnología de seguimiento de linaje basada en la edición de primos.
• Permitir el perfilado conjunto del estado celular y el linaje con alta resolución espacial.
• Para investigar la dinámica de las metástasis tumorales utilizando el PEtracer.

Principales métodos:

• Diseño y desarrollo de PEtracer, una herramienta de seguimiento de linaje basada en la edición principal.
• Integración de PEtracer con la secuenciación de una sola célula y la transcriptómica espacial MERFISH.
• Aplicación en un modelo de ratón singenético de metástasis tumoral.

Principales resultados:

• PEtracer perfila con éxito el estado celular y el linaje en células disociadas y tejidos intactos.
• Reconstrucción de la dinámica de crecimiento tumoral individual in vivo.
• Identificación de los factores celulares intrínsecos y celulares extrínsecos que coordinan el crecimiento tumoral.

Conclusiones:

• PEtracer ofrece un método potente para trazar la dinámica celular espacio-temporal.
• La tecnología facilita la caracterización sistemática del estado celular y las relaciones de linaje.
• PEtracer tiene amplias aplicaciones en biología del desarrollo, investigación de enfermedades y estudios de cáncer.