La presión inmune es clave para comprender los patrones observados de evolución del virus respiratorio en infecciones...

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología evolutiva
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• Las infecciones virales prolongadas, incluidas las causadas por el SARS-CoV-2 y otros virus respiratorios, muestran patrones evolutivos consistentes.
• Estos patrones incluyen tasas de sustitución no sinónimas aceleradas, diversificación del linaje, sustituciones paralelas y evolución antigénica variable.
• Comprender los impulsores de la evolución viral dentro del huésped es fundamental para controlar las infecciones persistentes.

Objetivo del estudio:

• Investigar los impulsores de los patrones evolutivos virales dentro del huésped observados en infecciones prolongadas utilizando simulaciones de modelos dentro del huésped.
• Para diferenciar los roles de las mutaciones de aptitud replicativa frente a la presión inmune en la configuración de la evolución viral.
• Para explorar cómo los diferentes niveles de presión inmune y amplitud influyen en la evolución viral.

Principales métodos:

• Utilizó simulaciones de modelos dentro del anfitrión basadas en un paisaje de acondicionamiento físico resistente ajustable.
• Se evaluó el impacto de las mutaciones que afectan únicamente a la capacidad de replicación viral.
• Sitos pleiotrópicos incorporados que afectan tanto a la aptitud replicativa como a la antigenización para modelar la presión inmune.

Principales resultados:

• Los patrones de evolución viral en infecciones prolongadas no se explican únicamente por paisajes de aptitud replicativos.
• La presión inmune es esencial para reproducir consistentemente los patrones empíricos observados de la evolución viral.
• Una presión inmune más fuerte y una amplitud inmune intermedia se correlacionan con un aumento del cambio antigénico.

Conclusiones:

• La presión inmune juega un papel importante en la conducción de patrones evolutivos virales durante infecciones prolongadas.
• Los hallazgos tienen implicaciones para comprender la evolución de varios virus, incluidos los que causan infecciones agudas, crónicas y prolongadas.
• Los modelos de simulación pueden dilucidar dinámicas evolutivas virales complejas bajo diferentes presiones selectivas.