Una biopsia líquida multivariada basada en células para la estratificación del riesgo de nódulos pulmonares:...

Área de la Ciencia:

• Biotecnología
• Diagnóstico molecular
• En el campo de la oncología

Sus antecedentes:

• La plataforma de ensayo de células indicadoras (iCAP) utiliza células vivas como biosensores para el diagnóstico basado en la sangre.
• Integra y amplifica las débiles señales de enfermedad del suero del paciente para su análisis.
• Las herramientas de aprendizaje automático analizan las respuestas transcriptómicas para desarrollar clasificadores de enfermedades.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y evaluar un iCAP específico para el cáncer de pulmón (LC-iCAP) como prueba de exclusión de nódulos pulmonares indeterminados.
• Evaluar la reproducibilidad analítica y la relevancia biológica del ensayo.
• Para estimar el rendimiento clínico de LC-iCAP en un estudio prospectivo de recolección de muestras y evaluación retrospectiva a ciegas (PRoBE).

Principales métodos:

• Se realizaron pruebas de parametrización y de reproducibilidad analítica.
• Se seleccionó un conjunto de características fijas de 85 genes para su futura validación clínica.
• Las variantes del clasificador fueron entrenadas y evaluadas utilizando validación cruzada anidada y validación temporal a ciegas en 176 muestras.

Principales resultados:

• El ensayo LC-iCAP demostró una excelente reproducibilidad en todas las condiciones y linajes celulares.
• Las señales transcriptómicas se enriquecieron para los genes hipoxia-responsivos, alineándose con la biología del cáncer de pulmón.
• Dos modelos mostraron capacidad discriminativa en validación a ciegas (AUC=0,64); un modelo combinado con tomografía computarizada logró una sensibilidad del 90% y un VAN del 95%.

Conclusiones:

• El estudio establece la reproducibilidad analítica y la relevancia biológica de LC-iCAP.
• Los resultados preliminares apoyan la utilidad potencial del ensayo en el manejo de nódulos pulmonares.
• LC-iCAP representa un nuevo paradigma para ensayos de biosensores basados en células escalables y rentables para biopsias líquidas y medicina de precisión.