Una duplicación de 17,1 kb aguas abajo de GATA6 está fuertemente asociada con el peso del huevo en pollo

Área de la Ciencia:

• La genómica y la ciencia avícola
• Genética animal y cría

Sus antecedentes:

• El peso de los huevos (PE) es un rasgo económico crucial en los pollos, con variaciones significativas observadas entre las diferentes razas.
• Los pollos de Danzhou (DZH) presentan un EW más bajo en comparación con el rango típico de pollos de plumas amarillas en China.

Objetivo del estudio:

• Identificar los genes candidatos y las variantes reguladoras que influyen en el peso del huevo (EW) en pollos de Danzhou (DZH) utilizando estudios de asociación de todo el genoma (GWAS).
• Investigar la base genética del fenotipo EW único en pollos DZH en comparación con los pollos Wenchang (WCH).

Principales métodos:

• Estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) utilizando datos de secuenciación de todo el genoma (WGS) de pollos DZH y WCH.
• Análisis de las variantes estructurales (SV-gwas) para identificar las duplicaciones asociadas con EW.
• La PCR cuantitativa (qPCR), los ensayos de doble luciferasa y el ATAC-seq para validar la función reguladora de la duplicación identificada.

Principales resultados:

• Se identificó una duplicación (dup) de 17,1 kb situada aguas abajo del gen GATA6 en el cromosoma 2 como significativamente asociada con EW.
• Los individuos con genotipos heterocigotos (dup/+) o homocigotos (dup/dup) para la duplicación presentaron pesos mínimos, medios y máximos de huevos significativamente más altos en comparación con los controles de tipo salvaje (+/+).
• La duplicación contiene una región potenciadora que aumenta la expresión del gen GATA6, en correlación con un mayor peso del huevo.

Conclusiones:

• Una nueva duplicación de 245 bp que contiene potenciador dentro de la región reguladora de GATA6 regula críticamente la variación del peso del huevo en pollos de plumas amarillas.
• Esta duplicación identificada sirve como un potencial marcador molecular para optimizar el tamaño de los huevos en los programas de cría de aves de corral.