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El papel de los genes relacionados con las mitocondrias y la infiltración inmune en la aterosclerosis carotídea: identificación de objetivos centrales a través de enfoques de bioinformática y aprendizaje automático

  • 0Department of Laboratory Diagnostics, First Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang, China.

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Resumen

Este resumen es generado por máquina.

Este estudio identifica tres genes clave relacionados con las mitocondrias (CASP8, GATM, LAP3) involucrados en la progresión de la aterosclerosis (AS). Estos genes interactúan con las células inmunes, ofreciendo nuevas vías para el monitoreo y tratamiento de la EA.

Área De La Ciencia

  • Biología cardiovascular
  • Inmunología
  • Medicina de las mitocondrias

Sus Antecedentes

  • La aterosclerosis (AS) es una de las principales causas de mortalidad cardiovascular, impulsada por la inflamación crónica y la disfunción mitocondrial.
  • La intrincada interconexión entre la infiltración de células inmunes y los cambios mitocondriales en la patogénesis de la EA sigue siendo incompletamente entendida.

Objetivo Del Estudio

  • Para aclarar la interacción entre los genes de expresión diferencial relacionados con las mitocondrias (Mito-DEG) y la infiltración de células inmunes en la aterosclerosis.
  • Identificar los actores moleculares clave y las vías involucradas en la progresión de la EA.

Principales Métodos

  • Análisis de conjuntos de datos de expresión génica (GSE100927, GSE43292) para identificar DEG y Mito-DEG comunes utilizando WGCNA y aprendizaje automático.
  • Análisis de infiltración inmune, validación de datos de secuenciación de ARN de una sola célula (GSE159677) y análisis de comunicación célula-célula.
  • Experimentos in vitro en los que se utilizan células de espuma derivadas de THP-1 para validar las Mito-DEG del eje mediante la qRT-PCR.

Principales Resultados

  • Se identificaron tres Mito-DEG hub, CASP8, GATM y LAP3, como asociados significativamente con el SA.
  • El perfil inmunológico reveló una mayor infiltración de mastocitos, monocitos, células B, células auxiliares foliculares T y macrófagos M0 en la EA.
  • GATM y LAP3 fueron enriquecidos en monocitos/macrófagos, CASP8 en células NK, células T y monocitos. Los estudios in vitro han confirmado el aumento de los Mito-DEG en las células de espuma.

Conclusiones

  • Este estudio destaca una interacción significativa entre los genes relacionados con las mitocondrias y el sistema inmunológico en la aterosclerosis.
  • Los genes hub identificados y sus asociaciones inmunológicas proporcionan nuevos conocimientos para las estrategias terapéuticas y los marcadores de pronóstico en la EA.