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Updated: Sep 10, 2025

Following the Dynamics of Structural Variants in Experimentally Evolved Populations

Following the Dynamics of Structural Variants in Experimentally Evolved Populations

Published on: February 3, 2023

La comparación de todo el genoma entre islas revela la dinámica microevolutiva del zorro rojo, estimulada a través de

Takumi Watanabe^1,2, Shin Shinojima Satoh^2,3, Toshiaki Shiraishi⁴

¹Division of Natural Environmental Science, Mount Fuji Research Institute, Yamanashi Prefectural Government, Fujiyoshida, Yamanashi 403-0005, Japan.

Genome biology and evolution

|August 21, 2025

Resumen

Las poblaciones de zorro rojo de la isla (Vulpes vulpes japonica) evolucionaron de forma independiente debido al aumento del nivel del mar posterior a la glaciación. El análisis genómico revela características genéticas e historias demográficas distintas en cada isla, destacando su significado evolutivo único.

Área de la Ciencia:

Biología evolutiva
Biogeografía de las islas
La genómica

Sus antecedentes:

Las islas continentales son sistemas clave para el estudio de la evolución alopátrica.
El zorro rojo hondo (Vulpes vulpes japonica) es una subespecie con una historia evolutiva compleja en el archipiélago japonés.
La comprensión de la genómica de la población de las islas proporciona información sobre la diversificación y la conservación de los organismos terrestres.

Objetivo del estudio:

Para reconstruir la historia biogeográfica a gran escala de las poblaciones de zorro rojo Hondo en tres islas japonesas.
Investigar el impacto de la dinámica geográfica y el cambio climático en la evolución genómica de las poblaciones insulares.
Evaluar la importancia evolutiva de las distintas poblaciones insulares para la conservación.

Principales métodos:

Construcción de nuevos conjuntos de genoma completo (∼2,4 Gbp) para cuatro zorros rojos de Hondo salvajes.
Estimación de la distancia genómica, la filogenia, la diversidad y la demografía.
Análisis de tiempos divididos y tramos de homozigosidad para reconstruir la historia biogeográfica espacio-temporal.

Principales resultados:

La distancia genómica en pares fue la más cercana entre los individuos de la misma isla, a pesar de la gran separación geográfica.
La divergencia filogenética y las corrientes de homocigosidad indicaron características genéticas distintas para cada población de la isla.
Se observaron trayectorias demográficas independientes después del Último Glacial, con diferenciación repentina durante el Hipsitérmico.

Conclusiones:

La transgresión marina postglacial que aisló las islas promovió fuertemente la evolución alopátrica, incluso en una especie altamente dispersable.
Las tres poblaciones de las islas representan unidades evolutivamente significativas distintas.
El estudio mejora la comprensión de la historia evolutiva del zorro rojo y la formación de la biodiversidad terrestre en las islas continentales.

Palabras clave:

Archipiélago japonés Evolución alopátrica genómica comparada isla continental Dinámica demográfica aislamiento geográfico

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