Vigilancia epidemiológica molecular de la enfermedad pulmonar micobacteriana no tuberculosa: estudio de cohorte...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Enfermedades infecciosas

Sus antecedentes:

• La enfermedad pulmonar micobacteriana no tuberculosa (NTMPD) es una infección crónica en la que los patógenos causantes pueden evolucionar a niveles de especies, subespecies o cepas.
• El seguimiento de estas dinámicas patógenas es crucial para un tratamiento eficaz, pero los métodos actuales son ineficientes.
• Las prácticas clínicas existentes carecen de herramientas sólidas para monitorear los cambios longitudinales en los patógenos de la NTMPD.

Objetivo del estudio:

• Investigar las especies/subespecies y la dinámica del nivel de cepa de las micobacterias en pacientes con NTMPD.
• Desarrollar y evaluar un método sencillo basado en secuencias para la determinación del nivel de cepa.
• Innovar en la gestión de la NTMPD mediante el monitoreo de patógenos en tiempo real.

Principales métodos:

• Estudio de cohorte prospectivo de 112 pacientes con TPMN.
• Secuenciación de todo el genoma de muestras de esputo en la inscripción y el seguimiento.
• Desarrollo y evaluación del método convencional de repetición en tándem de números variables (VNTR) y el nuevo método digital VNTR (dVNTR).

Principales resultados:

• Se detectaron desplazamientos de patógenos (especie/ subespecie o nivel de cepa) en el 25,9% de los pacientes durante más de 1,5 años.
• La secuenciación multilocal del genoma central identificó cambios de especies/subespecies en el 11,6% de los pacientes.
• La tipificación de VNTR y dVNTR detectó cambios de cepa en el 14,3% de los pacientes; los resultados de dVNTR se correlacionaron con el VNTR convencional.
• Se observaron cambios en la susceptibilidad antimicrobiana, con una mayor resistencia en pacientes sin desplazamientos patógenos detectables.

Conclusiones:

• Los desplazamientos de patógenos son un factor significativo en la NTMPD, que afecta a la susceptibilidad a los antimicrobianos.
• La identificación rutinaria de especies y subespecies y la tipificación molecular (VNTR) son vitales para la atención al paciente.
• La tipificación de secuenciación multilocal del genoma central combinada con dVNTR ofrece un enfoque innovador para monitorear la dinámica de los patógenos de la NTMPD y mejorar el manejo de los pacientes.