Análisis bioinformático y validación experimental de la relación potencial entre el lipopolisacárido bacteriano y el...

Área de la Ciencia:

• Oncología oral
• Patogénesis bacteriana
• La bioinformática en la investigación del cáncer

Sus antecedentes:

• Los factores de virulencia bacteriana, incluido el lipopolisacárido (LPS), están implicados en el desarrollo de tumores.
• El papel específico del LPS en el carcinoma de células escamosas orales (OSCC) sigue sin estar claro.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel y el mecanismo de las bacterias orales en el CCSO utilizando genes huéspedes relacionados con el SPL.
• Identificar posibles biomarcadores de diagnóstico y objetivos terapéuticos para el CCSO.

Principales métodos:

• Análisis bioinformático de los conjuntos de datos OSCC para identificar los genes de expresión diferencial relacionados con el LPS (LR-DEG).
• Análisis de enriquecimiento de la Ontología Genética (GO) y la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas (KEGG).
• Análisis de la red de interacción proteína-proteína (IPP) para identificar los genes hub relacionados con el LPS (LRHG).
• Validación de los gases de efecto invernadero de alta tensión mediante análisis qRT-PCR y ROC.

Principales resultados:

• Se identificaron 345 LR-DEG, enriquecidos principalmente en vías relacionadas con la inflamación como la interacción citoquina-receptor citoquina y la señalización de IL-17.
• Se identificaron cinco LRHG (Cxcl8, Cxcl10, Il- 1β, Il- 6, Mmp9) como biomarcadores diagnósticos potenciales para el CCSO con un AUC > 0,7.
• Los LRHG fueron regulados al alza en el OSCC y se correlacionaron con la infiltración de células inmunes, lo que sugiere un potencial terapéutico.
• El LPS bacteriano juega un papel importante en la progresión del CCSO a través de vías mediadas por la inflamación.

Conclusiones:

• Nuevos conocimientos sobre la patogénesis de la CCSO impulsada por las bacterias orales y el SPL.
• Los LRHG identificados son cruciales para el diagnóstico de la ECOS y ofrecen objetivos potenciales para nuevas terapias.
• Esta investigación pone de relieve el vínculo intrincado entre el LPS bacteriano, la inflamación y el desarrollo de OSCC.