TargetPair: Un recurso único de células ómicas de combinaciones de objetivos terapéuticos derivados de ensayos...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La bioinformática
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• El microambiente tumoral (TME) presenta desafíos significativos para la terapia del cáncer.
• Las estrategias de orientación múltiple muestran una promesa clínica, pero a menudo se basan en métodos empíricos.
• El diseño racional de pares objetivo (TP) para la terapia multiobjetivo es una prioridad.

Objetivo del estudio:

• Abordar la falta de datos completos sobre las TP del cáncer clínicamente relevantes y su caracterización de una sola célula.
• Establecer una base de datos manualmente anotada de TP con las características ómicas asociadas.
• Facilitar el diseño racional de terapias contra el cáncer con múltiples objetivos.

Principales métodos:

• Anotado manual de TP de combinaciones de fármacos y fármacos multi-objetivo con eficacia antitumoral evaluada.
• Cálculo de las características ómicas de una sola célula para TPs, incluida la coexpresión, la distribución y las fracciones celulares.
• Curando conjuntos de datos de secuenciación de ARN de una sola célula (scRNA-seq) de 55 publicaciones.

Principales resultados:

• La base de datos TargetPair contiene 60 TP aprobados, 1.580 en etapa clínica y 7.424 en etapa experimental.
• Las TP fueron anotadas de 3.470 ensayos clínicos y 1.396 publicaciones.
• Las características de Omics se derivaron de 3,022,556 células individuales en 13 tipos de células, 16 tipos de cáncer y 588 pacientes.

Conclusiones:

• La base de datos TargetPair proporciona un recurso valioso para comprender las TP a nivel de una sola célula.
• Este recurso puede ayudar en el diseño racional de nuevas terapias multi-objetivo contra el cáncer.
• La base de datos es de libre acceso en línea para fines de investigación.