Extracción eficaz de ARN con reactivos fácilmente disponibles: un análisis comparativo de los protocolos alternativos

Área de la Ciencia:

• Diagnóstico clínico
• Biología molecular
• Salud pública

Sus antecedentes:

• La pandemia de COVID-19 destacó las vulnerabilidades en los flujos de trabajo de laboratorio de diagnóstico, particularmente la escasez de reactivos y las limitaciones de automatización durante los períodos de alta demanda.
• La detección efectiva del SARS-CoV-2 se basa en la extracción robusta de ARN, que puede verse obstaculizada por las interrupciones de la cadena de suministro.

Objetivo del estudio:

• Evaluar los protocolos de preparación directa de muestras para la detección del SARS-CoV-2.
• Proponer y validar un método alternativo económico de extracción de ARN utilizando columnas genéricas de sílice para entornos con recursos limitados.

Principales métodos:

• Evaluación de cuatro protocolos de preparación directa de muestras.
• Desarrollo y evaluación de un nuevo protocolo de extracción de ARN utilizando columnas genéricas de sílice.
• Comparación estadística (ANOVA) del método alternativo con los protocolos estándar de extracción manual y automatizada.

Principales resultados:

• Los protocolos de preparación directa de muestras mostraron un mayor riesgo de falsos negativos.
• El método alternativo de extracción de ARN en columna de sílice arrojó resultados estadísticamente comparables a los de los protocolos estándar (ANOVA, p=0,415).
• El método alternativo exhibió una pérdida mínima de eficiencia, excepto en cargas virales muy altas.

Conclusiones:

• El método de extracción de ARN en columna de sílice propuesto es una alternativa factible, rentable y accesible durante la escasez de reactivos.
• Este enfoque puede mejorar la capacidad de los laboratorios de salud pública para gestionar las demandas de pruebas durante las presiones epidémicas y las limitaciones de la cadena de suministro.