Navegando por la incertidumbre en los flujos de trabajo del museo: minería de datos genómicos y curaduría de las...

Área de la Ciencia:

• Entomología
• La genómica
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Las colecciones de museos, como las extensas explotaciones de Diptera (Tephritidae y Syrphidae) del Museo Real para África Central (RMCA), son vitales para la investigación taxonómica y sistemática.
• La integración de datos genómicos en estas colecciones presenta desafíos debido a la heterogeneidad de la muestra y las condiciones de recolección desconocidas.

Objetivo del estudio:

• Evaluar la viabilidad de flujos de trabajo simplificados para la minería y el archivo de datos genómicos en grandes colecciones de insectos de museos.
• Evaluar la eficacia de la secuenciación del genoma entero de lectura corta de Illumina para especímenes de insectos degradados.

Principales métodos:

• Análisis del rendimiento, calidad y secuenciación del ADN de más de 1.400 vales de insectos.
• Aplicación de la secuenciación del genoma entero de lectura corta de Illumina a especímenes de museos.
• Adaptación del sistema de archivo de RMCA para incorporar datos genómicos y metadatos.

Principales resultados:

• Se observaron pocas tendencias predecibles en el rendimiento y la calidad del ADN en diversas muestras de insectos.
• La secuenciación de lectura corta de Illumina demostró ser efectiva para el material de insectos degradado, con una tasa de fracaso inicial de secuenciación del 7%.
• El sistema de archivo del RMCA se actualizó con éxito para integrar los datos genómicos con los registros de muestras tradicionales.

Conclusiones:

• La secuenciación de lectura corta de rutina es un primer paso práctico y rentable para la minería de datos genómicos en grandes colecciones de museos.
• Los datos genómicos deben considerarse parte integrante de la gestión de la recolección, mejorando el valor científico y la preservación a largo plazo.
• La integración de datos genómicos mejora la trazabilidad de los recursos genéticos dentro de las colecciones de historia natural.