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Updated: Sep 10, 2025

Oct4GiP Reporter Assay to Study Genes that Regulate Mouse Embryonic Stem Cell Maintenance and Self-renewal

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Published on: May 30, 2012

Toti: Una base de datos multi-ómicas integrada para descifrar la regulación epigenética de la expresión génica en las

Yi Chai¹, Ruiying Zhang², Shunze Jia²

¹Department of Nephrology, Children's Hospital, Zhejiang University School of Medicine, National Clinical Research Center for Child Health, Hangzhou, Zhejiang 310052, China; Liangzhu Laboratory, Zhejiang University, 1369 West Wenyi Road, Hangzhou, Zhejiang 311121, China; Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, Zhejiang 310058, China; Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, 10 Medical Dr, Singapore 117597, Singapore.

Stem cell reports

|August 22, 2025

Resumen

Las células madre totipotentes (CTS) son cruciales para el desarrollo temprano, pero carecen de datos exhaustivos. La nueva base de datos de Toti proporciona datos multiómicos para 8.284 muestras para explorar las TSC y sus mecanismos moleculares.

Área de la Ciencia:

Biología del desarrollo
La genómica
La epigenética

Sus antecedentes:

Las células madre totipotentes (CET) son fundamentales para la embriogénesis de los mamíferos, ya que poseen un gran potencial de diferenciación.
Las bases de datos embrionarias existentes carecen de datos epigenéticos y transcriptómicos cruciales sobre la totipotencia, lo que dificulta la investigación sobre su establecimiento y salida.
Comprender los mecanismos de totipotencia es vital para la biología del desarrollo y la medicina regenerativa.

Objetivo del estudio:

Para introducir Toti, una nueva base de datos multi-ómicos centrados en la totipotencia.
Proporcionar recursos transcriptómicos y epigenéticos completos para varios modelos TSC y embriones tempranos.
Facilitar la investigación sobre los factores moleculares que rigen la totipotencia.

Principales métodos:

Datos multiómicos compilados e integrados (transcriptómicos y epigenéticos) de 8.284 muestras.
Incluye diversos tipos de células: células transgénicas humanas y de ratón in vivo, in vitro y editadas por genoma, células similares a las células transgénicas, células madre pluripotentes y embriones de preimplantación.
Desarrolló módulos de búsqueda, navegación y análisis para la exploración de datos.

Principales resultados:

Toti ofrece un recurso centralizado para investigar la totipotencia.
La base de datos permite la visualización comparativa de las características transcriptómicas y epigenéticas.
Apoya el análisis de enriquecimiento de motivos y vías y los estudios de resolución de una sola célula.

Conclusiones:

Toti es un recurso pionero para explorar los fundamentos moleculares de la totipotencia.
Aborda la brecha crítica en los datos epigenéticos y transcriptómicos para las TSC.
La base de datos avanzará en nuestra comprensión del desarrollo temprano de los mamíferos y la biología de las células madre.

Palabras clave:

ATAC-seq (en inglés)En el caso de las PYME:Secuencia de ARN Toti también.base de datos células embrionarias multiómica Sector de la salud Totipotencia Células madre totipotentes

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