Los multiómicos unicelulares caracterizan los tumores colorrectales, los tejidos sanos adyacentes y los organoides...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• El cáncer colorrectal (CRC) implica mutaciones genéticas y crecimiento anormal de células en el colon.
• La comprensión de la base molecular de la progresión de la CCR es crucial para un tratamiento eficaz.

Objetivo del estudio:

• Para investigar el paisaje molecular del cáncer colorrectal utilizando multiómica de un solo núcleo.
• Comparar el tejido tumoral primario con los organoides derivados del paciente (DOP) para el modelado del cáncer.

Principales métodos:

• La secuenciación de ARN de un solo núcleo (snRNA-seq) y la secuenciación de ATAC de un solo núcleo (snATAC-seq) se realizaron en más de 100,000 núcleos.
• El análisis incluyó tejidos colorrectales primarios y DOP normales y tumorales coincidentes.
• Se utilizó un análisis inferido de la interacción célula-célula.

Principales resultados:

• Las DOP normales (N-DOP) reflejan la celularidad y la diferenciación de la cripta colorrectal.
• Las DOP tumorales (DOP-T) mostraron una heterogeneidad específica del paciente, manteniendo un estado similar al de las células madre.
• Los T-PDOs preservaron las mutaciones tumorales primarias y adquirieron otras nuevas; la señalización de la activina estuvo implicada en las interacciones del microambiente tumoral.

Conclusiones:

• Las DOP sirven como un modelo robusto para el estudio de las características moleculares del cáncer colorrectal.
• Esta investigación proporciona información sobre la transición del epitelio normal al maligno en el CCR.
• El estudio pone de relieve la utilidad de las DOP para capturar tanto las características de la CRC conservadas como las específicas del paciente.