Un enfoque integrador de la bioinformática revela la firma pronóstica impulsada por la fibrosis y el potencial...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• Biología molecular
• La genómica

Sus antecedentes:

• La fibrosis afecta significativamente la progresión tumoral y el microambiente inmunológico en el carcinoma renal de células claras (KIRC).
• El valor pronóstico de la fibrosis en KIRC y su influencia en la respuesta a la inmunoterapia requieren más investigación.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un modelo de pronóstico robusto para pacientes con KIRC basado en firmas genéticas relacionadas con la fibrosis.
• Para predecir los resultados del paciente y la respuesta a la inmunoterapia en KIRC.

Principales métodos:

• Se han seleccionado genes asociados a la fibrosis de múltiples bases de datos.
• Se analizaron datos de secuenciación de ARN de las cohortes TCGA, ICGC y E-MTAB-1980 KIRC.
• Se estableció y validó una firma relacionada con la fibrosis (FRS) utilizando la regresión de Cox y el análisis LASSO, incluido el enriquecimiento funcional, la inestabilidad genómica y las evaluaciones de infiltración celular inmune. El papel de PDGFRA fue investigado mediante experimentos in vitro e in vivo.

Principales resultados:

• Un FRS de cuatro genes (PDGFRA, SLC40A1, CXCL2, AGTR1) demostró una fuerte capacidad de pronóstico en KIRC.
• Los pacientes con alta FRS presentaron una peor supervivencia, una mayor inestabilidad genómica y perfiles inmunológicos distintos.
• PDGFRA fue identificado como un pronóstico clave; su eliminación redujo la proliferación, la migración y la tumorigenicidad, al tiempo que inhibió los marcadores de fibrosis.

Conclusiones:

• El FRS estratifica efectivamente a los pacientes con KIRC en función del pronóstico y la respuesta potencial a la inmunoterapia.
• Esta firma mejora la comprensión de la biología tumoral mediada por la fibrosis en el cáncer de riñón.
• Los hallazgos apoyan estrategias terapéuticas personalizadas para el KIRC.