La evolución, la variación y los patrones de expresión en desarrollo y las respuestas al estrés de la familia de...

Área de la Ciencia:

• Biología molecular de las plantas
• La genómica
• Biología evolutiva

Sus antecedentes:

• Los factores de transcripción NAC regulan el crecimiento de las plantas y las respuestas al estrés.
• La diversidad y la evolución de los NAC en la cebada (Hordeum vulgare) no se conocen bien.

Objetivo del estudio:

• Identificar y caracterizar la familia de factores de transcripción NAC (HvNAC) a través de múltiples adhesiones de cebada utilizando un enfoque pangenómico.
• Investigar la dinámica evolutiva, las variaciones genómicas y las funciones funcionales de los HvNAC en la cebada.

Principales métodos:

• Análisis pan-genómico de 20 adhesiones de cebada para identificar las HvNAC.
• Análisis filogenético para clasificar los HvNAC en subfamilias y evaluar las presiones de selección.
• Análisis de las variaciones genómicas (PAV, CNV) y perfiles transcriptómicos bajo estrés salino.

Principales resultados:

• Se identificaron 127-149 HvNAC por genoma, con el genoma Morex con el recuento más alto.
• Se clasifican los HvNAC en 201 ortogrupos (núcleo, núcleo blando, caparazón, linaje específico) y 12 subfamilias.
• Demostraron diversos patrones de expresión y respuestas al estrés, con genes centrales bajo selección purificadora y otros bajo selección relajada.

Conclusiones:

• Los HvNAC muestran una diversificación evolutiva y funcional significativa en la cebada.
• Las variaciones genómicas, en particular las impulsadas por elementos transponibles, contribuyen a la dinámica del locus HvNAC.
• Estos hallazgos ofrecen información valiosa para mejorar los programas de mejoramiento de la cebada.