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Updated: Sep 10, 2025

Targeted Next-generation Sequencing and Bioinformatics Pipeline to Evaluate Genetic Determinants of Constitutional Disease
Published on: April 4, 2018
Un análisis de microcoste y consecuencias de costo de un ensayo controlado aleatorio que compara la secuenciación del
Wendy J Ungar1, Vercancy Wu1, Christian R Marshall2
1Program in Child Health Evaluative Sciences, Hospital for Sick Children Research Institute, Toronto, ON, Canada.
La secuenciación del genoma (GS) es más costosa que la secuenciación del exoma (ES) para diagnosticar enfermedades raras, con rendimientos diagnósticos similares. Se necesitan más investigaciones para evaluar las variantes detectables únicamente por GS.
Área de la Ciencia:
- La genómica
- Economía médica
- Diagnóstico de enfermedades raras
Sus antecedentes:
- El diagnóstico de enfermedades raras presenta importantes desafíos financieros.
- Comprender la rentabilidad de los diferentes métodos de secuenciación genética es crucial para los proveedores de atención médica.
Objetivo del estudio:
- Secuenciación del exoma (ES) y secuenciación del genoma (GS) para el diagnóstico de enfermedades raras.
- Estimar los costos incrementales de GS en comparación con ES por diagnóstico adicional desde una perspectiva de pagador institucional.
Principales métodos:
- Trios asignados al azar (sonda más padres) a ES o GS.
- Microcostado del flujo de trabajo de laboratorio y procesos de secuenciación.
- Estimación probabilística de los costes totales y de categoría por trío, con el rendimiento diagnóstico como medida de la eficacia.
Principales resultados:
- El coste total medio por trío fue de 2888,79 CAD para ES y 4364,02 CAD para GS.
- Los costes de los reactivos constituyeron el 34% de los costes de la ES y el 61% de los costes de la GS.
- GS tenía un costo incremental de CAD 1475,23 con un rendimiento de diagnóstico del 32,7% en comparación con el 35,9% de ES.
Conclusiones:
- La secuenciación del genoma (GS) es más costosa que la secuenciación del exoma (ES) y ofreció un rendimiento de diagnóstico similar en este estudio.
- Las limitaciones técnicas en el momento del estudio pueden haber afectado el rendimiento diagnóstico de GS.
- Los hallazgos proporcionan datos de costos esenciales para comparar estrategias de diagnóstico y resaltan la necesidad de explorar variantes identificadas exclusivamente por GS.
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