Organización celular y espacial multiparamétrica en lesiones de tejido canceroso con una tubería aerodinámica

Área de la Ciencia:

• Biología computacional
• Patología
• Inmunohistoquímica

Sus antecedentes:

• El análisis de inmuno-coloración múltiple es complejo, laborioso y fragmentado.
• Los métodos proteómicos de tejidos actuales se enfrentan a desafíos con una creciente complejidad de marcadores.
• Se necesitan soluciones simplificadas y automatizadas para el análisis de tejidos unicelulares.

Objetivo del estudio:

• Para presentar MARQO, una tubería automatizada de código abierto para el análisis de imágenes multiplex.
• Para racionalizar el análisis de resolución de una sola célula de tejido de diapositiva entera de principio a fin.
• Validar el rendimiento de MARQO en comparación con las determinaciones manuales y los métodos de cuantificación existentes.

Principales métodos:

• MARQO integra el registro elástico de imágenes, la segmentación nuclear iterativa y el agrupamiento sin supervisión (mini-partida k-media).
• Una interfaz gráfica permite la clasificación de las células guiada por el usuario.
• La validación incluyó la tinción inmunohistoquímica multiplexada en el tumor humano y los tejidos normales adyacentes.

Principales resultados:

• MARQO analizó con éxito diversos tamaños de tejidos y enfoques de tinción (IHC de un solo color, IF de 20 colores).
• La tubería determinó con precisión los patrones de coexpresión de marcadores en varios tipos de cáncer sólido.
• MARQO identificó el enriquecimiento de células T CD8+ en pacientes con carcinoma hepatocelular que respondieron al neoadyuvante cemiplimab.

Conclusiones:

• MARQO ofrece una solución eficiente y precisa para el análisis de imágenes múltiples con resolución de una sola célula.
• La tubería es adaptable para varios tipos de tejidos, tamaños y métodos de tinción.
• MARQO puede revelar mecanismos de resolución espacial in situ cruciales para comprender la biología del cáncer y la respuesta al tratamiento.