JMJD6 y YBX1 interactúan físicamente y regulan el promotor proximal HOTAIR

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Investigación del cáncer
• La epigenética

Sus antecedentes:

• Trabajos anteriores identificaron el dominio jumonji que contiene la proteína 6 (JMJD6) que se une al promotor HOTAIR.
• Una investigación adicional reveló una región reguladora adicional aguas arriba del sitio de unión JMJD6.
• Los datos de silico y ENCODE sugieren que la proteína de interacción de la caja Y 1 (YBX1) se une a esta región aguas arriba.

Objetivo del estudio:

• Validar la interacción entre JMJD6 y YBX1 en líneas celulares de cáncer de mama.
• Para aclarar las consecuencias funcionales de la interacción JMJD6-YBX1 en la expresión HOTAIR.
• Determinar el mecanismo por el cual YBX1 influye en el reclutamiento de JMJD6 para el promotor de HOTAIR.

Principales métodos:

• Pruebas de co-inmunoprecipitación para confirmar las interacciones proteína-proteína.
• Mapeo de dominio utilizando construcciones de eliminación.
• Los reporteros de Luciferase evalúan la actividad del promotor.
• Depleción mediada por siRNA y knockout genético (YKO) para estudiar los efectos funcionales.
• Los ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP y ChIP-re-ChIP) y de desplazamiento de la movilidad electroforética (EMSA).

Principales resultados:

• JMJD6 y YBX1 interactúan directamente, con el dominio A / P de YBX1 que une el dominio JMJC de JMJD6.
• YBX1 mejora la actividad del promotor HOTAIR, y su agotamiento o mutación de la región de interacción YBX1 (YIR) reduce la actividad.
• Tanto JMJD6 como YBX1 co-ocupan el promotor HOTAIR, y YBX1 es crucial para el reclutamiento de JMJD6.
• Existe un bucle de alimentación positiva donde JMJD6 e YBX1 se regulan mutuamente la expresión, lo que lleva a una mayor inducción de HOTAIR.

Conclusiones:

• YBX1 es esencial para reclutar JMJD6 para el promotor HOTAIR en las células de cáncer de mama.
• La interacción JMJD6-YBX1 y su bucle de retroalimentación positiva impulsan la expresión HOTAIR.
• Este mecanismo contribuye a la progresión tumoral, destacando JMJD6 y YBX1 como posibles objetivos terapéuticos.