El primer descubrimiento del grupo IV GETV de Pangolin, China

Área de la Ciencia:

• Virología
• La genómica
• Epidemiología

Sus antecedentes:

• El virus de Geta (GETV) es un alfavirus con circulación conocida en varias regiones.
• Los estudios anteriores no han identificado a los pangolines como huéspedes del GETV.
• La provincia de Guangxi en China no había informado previamente sobre el GETV del Grupo IV.

Objetivo del estudio:

• Informar de la primera detección del virus Geta del grupo IV (GETV) en pangolines.
• Para caracterizar una nueva cepa GETV de Guangxi, China.
• Evaluar la velocidad evolutiva y las variaciones genéticas de la cepa GETV detectada.

Principales métodos:

• Detección y secuenciación de ARN viral en muestras de pangolín.
• Análisis filogenético usando inferencia bayesiana.
• Comparación de secuencias de aminoácidos y análisis de estructuras de proteínas.

Principales resultados:

• Se identificó una nueva cepa GETV del Grupo IV (CHIKV-China/GX2020) en un pangolín, que representa un nuevo huésped y la primera detección en Guangxi.
• La nueva cepa muestra una alta homología con el aislado GETV de Tailandia de 2017.
• El análisis bayesiano indicó una tasa evolutiva de 3.487 × 10-4 sustituciones / sitio / año, con mutaciones significativas en la proteína estructural E2, incluida E2-H207N.

Conclusiones:

• El descubrimiento de GETV en pangolines requiere una reevaluación de los potenciales reservorios de animales.
• La mutación identificada (E2-H207N) puede afectar a la infectividad o patogenicidad del GETV, lo que requiere una investigación adicional.
• Las capacidades actuales de vigilancia y diagnóstico de GETV deben mejorarse para abordar con eficacia los brotes potenciales.