Heterogeneidad genómica y beta-lactamasas específicas del linaje en pacientes con infecciones recurrentes de...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Enfermedades infecciosas

Sus antecedentes:

• Las infecciones recurrentes de Achromobacter presentan desafíos clínicos debido a la resistencia a los antimicrobianos y la evolución en los pacientes.
• La identificación precisa y la comprensión de los mecanismos de resistencia son cruciales para un tratamiento eficaz.

Objetivo del estudio:

• Investigar los cambios genéticos y fenotípicos en los aislamientos de Achromobacter por infecciones recurrentes utilizando la secuenciación de todo el genoma.
• Mejorar la identificación de especies y detectar patrones de resistencia a los antimicrobianos.

Principales métodos:

• Análisis retrospectivo de 65 casos de infección por Achromobacter entre 2016 y 2023.
• Secuenciación de todo el genoma (Oxford Nanopore) de 12 aislamientos de infecciones recurrentes del torrente sanguíneo.
• Identificación de genes de resistencia, beta-lactamasas y análisis filogenético utilizando la identidad de nucleótidos promedio (ANI).

Principales resultados:

• Las infecciones recurrentes se relacionaron con infecciones del torrente sanguíneo y del tracto urinario (p<0,01).
• La secuenciación de todo el genoma identificó una nueva especie de Achromobacter y el primer caso de bacteriemia de A. insuavis, superando a MALDI-TOF MS.
• La distribución de la beta-lactamasa está correlacionada con los clados filogenéticos, mostrando resistencia específica del linaje. Las mutaciones de error en genes específicos (siaT, rapA, atzEa1, AL523_09115, clpA) se asociaron con cambios en la resistencia a los antimicrobianos.

Conclusiones:

• La secuenciación de todo el genoma mejora la identificación de especies de Achromobacter y la detección de resistencia a los antimicrobianos.
• La heterogeneidad genética y la evolución in vivo contribuyen a las infecciones recurrentes.
• Se necesitan más estudios a gran escala para controlar las variantes y su impacto clínico.