QC4Metabolomics: Control de calidad en tiempo real y retrospectivo de los datos metabológicos

Área de la Ciencia:

• Metabolomía
• Química analítica
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Los datos de alta calidad son cruciales para responder preguntas biológicas complejas en metabolómica.
• La adquisición de datos de cromatografía líquida y espectrometría de masas (LC-MS) es compleja, lo que a menudo conduce a problemas de control de calidad (QC) como la pérdida de calibración m / z, la deriva del tiempo de retención y la supresión de iones.
• Las prácticas actuales de control de calidad a menudo son de posprocesamiento, lo que es demasiado tarde para corregir los problemas analíticos, lo que lleva a datos comprometidos y desperdicio de recursos.

Objetivo del estudio:

• Introducir QC4Metabolomics, un nuevo software para el control de calidad en tiempo real de los datos metabolomicos no dirigidos.
• Proporcionar una herramienta que pueda identificar y señalar problemas analíticos durante o inmediatamente después de la adquisición de datos.
• Permitir la mitigación inmediata de los problemas, mejorando así la calidad de los datos y reduciendo la necesidad de un nuevo análisis.

Principales métodos:

• QC4Metabolomics monitorea los archivos de datos durante el proceso o de forma retrospectiva.
• Rastrea los compuestos definidos por el usuario, extrayendo información de diagnóstico que incluye m/z observado, tiempo de retención, intensidad y forma de pico.
• El software también supervisa los contaminantes comunes o definidos por el usuario y presenta los resultados a través de un panel web.

Principales resultados:

• Los ejemplos del mundo real demuestran la capacidad de QC4Metabolomics para identificar retrospectivamente problemas analíticos.
• Estos problemas, si se hubieran monitoreado en tiempo real, podrían haberse abordado de inmediato, evitando el análisis de muestras comprometidas.
• El software facilita la detección inmediata de problemas como la pérdida de calibración m/z y la deriva del tiempo de retención.

Conclusiones:

• QC4Metabolomics proporciona un control de calidad esencial en tiempo real para la adquisición de datos metabolomicos no dirigidos.
• La implementación de este software puede mejorar significativamente la calidad y fiabilidad de los datos en los estudios metabolómicos.
• La disponibilidad de código abierto y las opciones de fácil implementación (Docker) promueven la adopción y la accesibilidad generalizadas.