Traer la mayoría microbiana no cultivada de los ecosistemas de agua dulce al cultivo

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• Ecología
• La genómica

Sus antecedentes:

• Los cultivos axénicos son cruciales para la investigación microbiana, pero las colecciones públicas carecen de muchos microbios acuáticos abundantes.
• Los estilos de vida oligotróficos y las necesidades de crecimiento no caracterizadas dificultan el cultivo de muchos procariotas.

Objetivo del estudio:

• Para cultivar abundantes procariotas de agua dulce no cultivadas anteriormente.
• Ampliar las colecciones de cultivos microbianos con cepas pertinentes para los entornos acuáticos naturales.

Principales métodos:

• Cultivo aplicado de dilución a extinción de alto rendimiento.
• Se utilizan medios definidos que imitan las condiciones oligotróficas naturales.
• Se tomaron muestras de 14 lagos de Europa Central.

Principales resultados:

• Se obtuvieron con éxito 627 cepas axénicas, incluidos 15 géneros que representan hasta el 72% de las bacterias de agua dulce abundantes.
• Las cepas cultivadas están estrechamente relacionadas con los genomas ensamblados por metagenoma (MAG), incluidos los nuevos taxones.
• Caracterizó diversas vías metabólicas y estilos de vida de estos microbios abundantes.

Conclusiones:

• Esta iniciativa cultivó la "mayoría microbiana no cultivada", lo que produjo un recurso valioso para los estudios ecológicos.
• La colección proporciona nuevos organismos modelo oligotróficos para el avance de la ecología microbiana y la investigación de la evolución.
• Clasificación propuesta para varias familias, géneros y especies novedosas, enriqueciendo los repositorios públicos.