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Updated: Sep 10, 2025
Performing Data Mining And Integrative Analysis Of Biomarker in Breast Cancer Using Multiple Publicly Accessible Databases
Published on: May 17, 2019
Un servicio web basado en Hiplot para la integración y el análisis de datos de alto rendimiento de plasma atmosférico
Xiaofeng Dai1, Mingjie Wang2, Yang Liu1
1National Local Joint Engineering Research Center for Precision Surgery & Regenerative Medicine, Shaanxi Provincial Center for Regenerative Medicine and Surgical Engineering The First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University, Xi'an Jiaotong University Xi'an China.
El plasma atmosférico frío (CAP) es prometedor para el tratamiento del cáncer. Este estudio proporciona la primera base de datos multiómica (CAPmed-BC) para analizar la PAC.
Área de la Ciencia:
- Medicina con plasma
- En el campo de la oncología
- Investigación multiómica
Sus antecedentes:
- La evidencia creciente sugiere que el plasma atmosférico frío (CAP) ataca selectivamente a las células cancerosas.
- Los avances en la secuenciación multiómica requieren una comprensión molecular más profunda de los mecanismos anticancerígenos de CAP.
- La falta de datos completos de alto rendimiento, bases de datos y herramientas analíticas obstaculiza la investigación de la PAC en oncología.
Objetivo del estudio:
- Para explorar los mecanismos moleculares de la eficacia de CAP contra las células cancerosas.
- Desarrollar una nueva base de datos multiómica y una plataforma analítica para la respuesta al tratamiento de la PAC en el cáncer de mama.
- Proporcionar un recurso para caracterizar los efectos de la PAC en el cáncer a nivel molecular y químico.
Principales métodos:
- Secuenciación completa del transcriptoma, proteoma, fosforiloma, acetiloma y lactiloma de las células de cáncer de mama tratadas con CAP.
- Desarrollo del módulo CAPmed-BC en el cáncer de mama en la plataforma Hiplot (https://capbc.hiplot.com.cn).
- Se utilizó CAPmed-BC para el análisis de biomarcadores diferenciales, la interpretación de vías y el análisis de redes de interacción proteína-proteína.
Principales resultados:
- Generó el primer conjunto de datos multi-ómicos para analizar la respuesta al tratamiento CAP en el cáncer de mama.
- CAPmed-BC permite un análisis exhaustivo de los datos de las sustancias tóxicas, incluidas las fluctuaciones dinámicas y las vulnerabilidades metabólicas.
- Integrado un módulo de visualización para la generación de gráficos personalizados.
Conclusiones:
- CAPmed-BC es un recurso pionero para comprender los efectos de CAP en el cáncer de mama a nivel multiómico.
- Esta plataforma facilita la caracterización molecular en profundidad de los mecanismos anticancerígenos del CAP.
- Se espera que el recurso contribuya significativamente a los avances en medicina plasmática y oncología.
