Definir un buen pronóstico del codón 659 mutado y las firmas genómicas concomitantes en CRC: un análisis de la base...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Heterogeneidad del cáncer

Sus antecedentes:

• El cáncer colorrectal (CCR) presenta una heterogeneidad significativa que afecta la supervivencia global (SG).
• RNF43 se identifica como un nuevo marcador predictivo para el pronóstico de CRC y la respuesta a las terapias anti-BRAF/EGFR.
• Existe una investigación limitada sobre la interacción entre las mutaciones de RNF43, los perfiles de co-mutación y el pronóstico de CRC.

Objetivo del estudio:

• Investigar los distintos subtipos de pronóstico dentro del CRC mutado por RNF43.
• Analizar las asociaciones entre las características clínicas patológicas, genómicas y los resultados de supervivencia en el CRC mutado por RNF43.
• Explorar el valor pronóstico de las mutaciones de RNF43 junto con las co-mutaciones como el estado de BRAF y MSI.

Principales métodos:

• Análisis retrospectivo de los datos de pacientes con CCR (N=4028) de cBioPortal, filtrados por un panel de 1021.
• Se utilizó el análisis de regresión de Cox para identificar biomarcadores pronósticos.
• El análisis de subgrupos se centró en el estado de inestabilidad de BRAF y microsatélite (MSI); validado en una cohorte independiente (N=339).

Principales resultados:

• Las mutaciones de desplazamiento de marco del codón RNF43 659 fueron frecuentes, predominantemente en el CCR del lado derecho, y asociadas con una alta carga mutacional tumoral (TMB-H) y MSI-H (78, 81%).
• El estado MSI-H predijo de forma independiente un mejor pronóstico (P=0,004), mientras que el BRAF V600E de Clase 1 predijo un peor pronóstico (P<0,001).
• Un subtipo (G1: codón RNF43 659 mutado, no mutado por BRAF Clase 1, MSI-H) demostró una supervivencia libre de progresión (SFP) y una supervivencia normal significativamente mejores, con enriquecimiento en las vías clave de señalización del cáncer.

Conclusiones:

• El subtipo G1 (RNF43 con codón 659 mutado, sin mutación BRAF de Clase 1, MSI-H) presenta el pronóstico más favorable en el CCR.
• Los pacientes con mutaciones no codón 659 de RNF43, BRAF V600E y MSS presentan el pronóstico más pobre.
• Estos hallazgos ofrecen potencial para la predicción de pronósticos refinados, la evaluación de la respuesta al tratamiento y las estrategias de manejo de pacientes en CCR.