Identificación basada en el aprendizaje automático y validación experimental de genes de cuproptosis relacionados con...

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Biología molecular
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• El papel de la ferroptosis y la cuproptosis en la nefritis por lupus (LN) sigue siendo en gran parte inexplorado.
• Comprender estas vías de muerte celular es crucial para avanzar en la investigación de la patogénesis de la LN.

Objetivo del estudio:

• Investigar la expresión y el impacto funcional de los genes de cuproposis relacionados con la ferroposis (FRCG) en la LN.
• Identificar posibles biomarcadores de diagnóstico y objetivos terapéuticos para la LN.

Principales métodos:

• Se han descargado y analizado conjuntos de datos relacionados con el LN (GSE112943, GSE32591) de la base de datos GEO.
• Utilizó el análisis de la red de coexpresión de genes ponderados (WGCNA) y el aprendizaje automático para identificar los FRCG centrales.
• Se han realizado experimentos in vivo e in vitro para la validación de la expresión de FRCG y la correlación con la infiltración inmune.

Principales resultados:

• Se identificaron 31 FRCG expresados diferencialmente (DE-FRCG) involucrados principalmente en la respuesta de iones metálicos y el estrés oxidativo.
• El aprendizaje automático identificó a JUN y ZFP36 como FRCG clave.
• Se confirmó la expresión reducida de JUN y ZFP36 en pacientes con LN y se validó su correlación negativa con los macrófagos y los monocitos en los riñones de LN.

Conclusiones:

• Los genes de cuproptosis relacionados con la ferroptosis contribuyen a la patogénesis de la LN.
• JUN y ZFP36 son prometedores como biomarcadores potenciales y objetivos terapéuticos para la nefritis por lupus.