Evaluación de los predictores basados en la expresión génica de la metástasis de los ganglios linfáticos en el cáncer...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Descubrimiento de biomarcadores

Sus antecedentes:

• La metástasis de los ganglios linfáticos en el cáncer de vejiga invasivo muscular (CIMM) tiene un impacto significativo en el pronóstico del paciente.
• Se necesita una predicción preoperatoria precisa del estado de los ganglios linfáticos para guiar la quimioterapia neoadyuvante y el grado de disección de los ganglios linfáticos.
• Los predictores basados en la expresión de ARN existentes para el estado del nodo en MIBC carecen de una validación externa sólida.

Objetivo del estudio:

• Validar sistemáticamente todas las firmas de expresión de ARN publicadas previamente para predecir el estado de los ganglios linfáticos en la CIM.
• Desarrollar y evaluar nuevos modelos de predicción para el estado de los ganglios linfáticos en el CMI utilizando datos de expresión génica.

Principales métodos:

• Se utilizaron datos de expresión génica y estado clínico del nodo de dos cohortes independientes de MIBC.
• Se probaron 12 firmas genéticas predictivas de nodos publicadas para el rendimiento en conjuntos de datos de validación.
• Desarrollo y validación cruzada de nuevos modelos de predicción, evaluando su rendimiento en una cohorte MIBC independiente.

Principales resultados:

• Los predictores de estado de los nodos publicados demostraron un valor predictivo mínimo, con un rendimiento cercano a los niveles de probabilidad en la validación independiente (máximo AUC 0,65).
• Se identificó la regulación al alza de las firmas de respuesta al interferón en casos nodos-negativos entre genes expresados de manera consistente.
• Los predictores transcriptómicos entrenados en un conjunto de datos mostraron una mala generalización a una cohorte MIBC independiente (AUC 0,60- 0,62).

Conclusiones:

• Las 12 firmas de expresión de ARN publicadas anteriormente son inadecuadas para la predicción del estado clínico de los nodos en MIBC.
• Los modelos de predicción recientemente desarrollados tampoco lograron una precisión suficiente en los datos independientes.
• Los perfiles de expresión de ARN del tumor en masa parecen insuficientes para capturar los factores biológicos de la metástasis de los ganglios linfáticos en el CMI.