El análisis de la red de coexpresión sugiere que el factor de transcripción PacC está involucrado en la patogenia de...

Área de la Ciencia:

• Patología vegetal
• Biología molecular
• Micología

Sus antecedentes:

• Botryosphaeria dothidea causa cáncer de tronco de hickory chino, una amenaza significativa para la producción de Carya cathayensis.
• La transición de fase endofítico-patógena, o infección latente, es clave para la interacción de B. dothidea con los huéspedes, pero sigue siendo poco comprendida.

Objetivo del estudio:

• Investigar los cambios de transcripción en B. dothidea durante su transición de fase tras la interacción con el hickory chino.
• Identificar los genes clave y los mecanismos reguladores involucrados en la fase de infección latente.

Principales métodos:

• Se utilizó la secuenciación de ARN (RNA-Seq) para analizar la expresión génica.
• El análisis de la red de coexpresión identificó genes expresados diferencialmente (DEG) y genes hub.
• Se realizaron análisis de enriquecimiento de la ontología genética (GO) y experimentos de nocaut genético.

Principales resultados:

• Se identificó un módulo coexpresado correlacionado con condiciones de infección latente simuladas.
• Se detectaron cincuenta y tres genes centrales, enriquecidos en transporte transmembrana, homeostasis iónica y metabolismo de carbohidratos.
• Un factor de transcripción PacC (BDLA_00001555) y una endo-β- 1, 3- glucanasa (BDLA_00010249) fueron regulados al alza durante la activación patógena.
• Knock-out de la activación del estado patógeno alterado de BDLA_00001555.

Conclusiones:

• El factor de transcripción PacC BDLA_00001555 juega un papel crítico en la fase de infección latente de B. dothidea.
• Estos hallazgos ofrecen información sobre los mecanismos patógenos del cáncer de tronco de hickory chino.