Análisis genómico de los genomas de las lacarias a gran altitud

Área de la Ciencia:

• * La genómica y la biología evolutiva
• * Micología
• * Adaptación a la altitud

Sus antecedentes:

• * La meseta Qinghai-Tibet (QTP) presenta condiciones ambientales extremas (baja temperatura, alta radiación UV, hipoxia) que dificultan la adaptación biológica.
• * Los mecanismos genéticos de adaptación de los macrofungos a las altitudes altas en el QTP son poco conocidos.

Objetivo del estudio:

• * Investigar las bases genómicas de la adaptación en tres especies de *Laccaria* del QTP.
• * Identificar los factores genéticos que contribuyen a la supervivencia en entornos de altitud extrema.

Principales métodos:

• * Secuenciación del genoma de novo y ensamblaje de tres especies de *Laccaria* del QTP.
• * Análisis genómico comparativo entre parientes de gran altitud y de baja altitud.
• * Análisis de la expansión / contracción de la familia de genes, selección positiva y enzimas activas en carbohidratos (CAZymes).

Principales resultados:

• * Los genomas de *Laccaria* de gran altitud son más grandes, principalmente debido a las retrotransposones LTR negativamente correlacionadas con la altitud.
• * Las familias de genes expandidos en especies de gran altitud están relacionadas con la reparación del ADN, la estabilidad de la membrana celular, la transducción de señales, la respuesta al estrés y la reproducción.
• * Las familias de genes contraídos están asociadas con respuestas inmunológicas y distintas distribuciones de CAZyme sugieren adaptación.
• * Los genes específicos de la especie en los hongos de gran altitud se enriquecen en la actividad enzimática, la estabilidad de la membrana y las funciones de transducción de señales.

Conclusiones:

• * La expansión del genoma a través de retrotransposones LTR, la evolución de la familia de genes, la selección positiva y la divergencia de CAZyme contribuyen a la adaptación a gran altitud en *Laccaria*.
• * Los hallazgos proporcionan datos fundamentales sobre los mecanismos genéticos de adaptación de los hongos a entornos de meseta extremos.
• * Este estudio mejora la comprensión de los hongos extremófilos y sus estrategias evolutivas.