El análisis comparativo del plastoma revela la dinámica evolutiva y los patrones de uso de codones en Bidens...

Área de la Ciencia:

• Genómica de las plantas
• Biología evolutiva
• Filogenomía

Sus antecedentes:

• La evolución del plastoma en diversas angiospermas no se entiende completamente, especialmente los impulsores del sesgo de uso de codones (CUB) y la evolución adaptativa.
• El género Bidens (Asteraceae) es un grupo diverso con un valor económico y medicinal significativo, lo que lo convierte en un modelo clave para los estudios evolutivos.

Objetivo del estudio:

• Investigar la evolución del plastoma en Bidens mediante el análisis de la estructura del genoma, las SSR, CUB y las presiones de selección.
• Comprender los mecanismos que impulsan el CUB y la evolución adaptativa dentro de este género rico en especies.

Principales métodos:

• Reunió el plastoma completo de Bidens alba y realizó análisis comparativos en 31 especies de Bidens.
• Se utilizó la reconstrucción filogenómica, la caracterización estructural, el análisis SSR, las relaciones Ka/Ks y la evaluación CUB.

Principales resultados:

• Los plastomas de Bidens están estructuralmente conservados con sesgo de AT y SSR de mononucleótidos.
• La selección natural impulsa CUB, con la mayoría de los genes bajo selección purificadora, pero ycf2 y accD muestran evolución adaptativa.
• El análisis filogenómico confirma la monofilia de Bidens y resuelve las relaciones de especies.

Conclusiones:

• Los plastomas de Bidens exhiben una notable conservación estructural junto con la evolución activa de la secuencia.
• Estos hallazgos iluminan los mecanismos evolutivos del plastoma en linajes que se diversifican rápidamente y proporcionan una base genómica para comprender la adaptación y la filogenia en los Bidens.