Adaptación al clima local en los genomas de cerdos indígenas chinos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Ciencias de los animales
• Biología evolutiva

Sus antecedentes:

• La adaptación local es crucial para la supervivencia del ganado en diversos entornos, pero su base genética a menudo no está clara.
• Los cerdos indígenas chinos poseen una rica diversidad genética, lo que los convierte en un modelo ideal para estudiar la adaptación ambiental.
• Comprender la arquitectura genómica de la adaptación es vital para la conservación del ganado y los programas de cría sostenibles.

Objetivo del estudio:

• Investigar las bases genómicas de la adaptación local en cerdos indígenas chinos.
• Identificar las variantes genéticas y las vías asociadas con los factores ambientales, especialmente la precipitación.
• Informar sobre las estrategias de cría y conservación resistentes al clima para el ganado.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma completo de 578 individuos de 46 razas de cerdos nativos.
• Análisis de la asociación genotipo-ambiente (AGE) a nivel de todo el genoma utilizando modelos mixtos de factores latentes (MMLL).
• El análisis de redundancia (RDA), el modelado de bosques gradientes y la anotación funcional de SNP significativos.

Principales resultados:

• Se identificaron 8644 SNPs asociados con factores ambientales, de los cuales 310 estaban relacionados con la precipitación en el trimestre más húmedo (BIO16).
• BIO16 surgió como un factor ambiental significativo de la variación genómica en las poblaciones de cerdos.
• El análisis funcional destacó el enriquecimiento en elementos reguladores y genes relacionados con las vías inmunológicas y metabólicas (pulmón, bazo, hipotálamo, intestino).
• El locus MS4A7 mostró fuertes señales de adaptación relacionadas con la precipitación.

Conclusiones:

• La adaptación local de los cerdos chinos está determinada por factores ambientales, en los que la precipitación juega un papel clave.
• Las vías inmunológicas y metabólicas están implicadas en la adaptación de los cerdos a condiciones climáticas variables.
• Los resultados proporcionan información sobre la adaptación del ganado y apoyan el desarrollo de estrategias de cría y conservación resistentes al clima.