Epidemiología genómica de enterobacterias productoras de ESBL y carbapenemasa en un hospital español: explorando la...

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Epidemiología

Sus antecedentes:

• La resistencia a los antimicrobianos (AMR), impulsada por las β-lactamasas de espectro extendido (ESBL) y las carbapenemasas (CP), es un problema de salud mundial crítico.
• Escherichia coli (Ec) y Klebsiella pneumoniae (Kp) son patógenos clave que exhiben la producción de ESBL y CP, lo que requiere una caracterización molecular y genómica detallada.

Objetivo del estudio:

• Caracterizar la epidemiología molecular, los perfiles de resistencia y las características genómicas de los aislados clínicos Ec/Kp (ESBL/CP-Ec/Kp) productores de ESBL y CP.
• Explorar posibles vínculos entre las cepas clínicas ESBL/CP-Ec/Kp y los depósitos ambientales, específicamente las cigüeñas blancas en un vertedero cercano.
• Evaluar el papel de la secuenciación del genoma completo (WGS) en la comprensión de la propagación de la resistencia antimicrobiana y en la orientación de las intervenciones en el marco de "Una sola salud".

Principales métodos:

• Se realizaron pruebas fenotípicas, PCR y secuenciación del genoma completo (WGS) en 121 aislamientos clínicos de Ec/Kp.
• Los análisis incluyeron filogenómica (cgMLST), detección de genes de AMR, tipificación de plásmidos y genómica comparativa.
• El análisis genómico comparó aislamientos clínicos con cepas ambientales (derivadas de la cigüeña).

Principales resultados:

• El ESBL-Ec prevalente albergaba CTX-M-15, mientras que un CP-Ec llevaba NDM-5. El linaje ST131 dominó ESBL-Ec (75%).
• Los aislamientos de ESBL/CP-Kp fueron con frecuencia ST307 (44,4%), ST15 y ST11, portadores de diversos determinantes y plásmidos de la resistencia a los antimicrobianos.
• El análisis genómico reveló estrechos vínculos filogenéticos (≤22 ADs para Ec, ≤10 ADs para Kp) entre las cepas clínicas y las derivadas de la cigüeña, lo que indica mecanismos de resistencia compartidos y contenido de plásmidos.

Conclusiones:

• Los clones ESBL/CP-Ec/Kp de alto riesgo son persistentes tanto en entornos clínicos como ambientales, lo que sugiere vías de transmisión interconectadas.
• La vigilancia basada en WGS es crucial para comprender la diseminación de la resistencia antimicrobiana e informar sobre estrategias de control efectivas.
• Los hallazgos apoyan el enfoque de "Una sola salud", que hace hincapié en la colaboración intersectorial para combatir la resistencia a los antimicrobianos.