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Updated: Jun 12, 2026

12:37
Efficient Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene Sequencing for Bacterial Community Characterization
Published on: April 14, 2016
39.0K
Dinámica y mecanismos de ensamblaje de las comunidades bacterianas durante el desarrollo larval de Macrobrachium
Zhibin Lu1,2, Jingwen Hao1,2, Jilun Meng1
1Xianghu Laboratory, Hangzhou 311231, China.
Microorganisms
|August 28, 2025
Resumen
Las comunidades bacterianas en las larvas de camarón de agua dulce gigante muestran dinámicas distintas específicas de la etapa, con taxones dominantes que coexisten a través de la partición de nicho. El ensamblaje microbiano está impulsado principalmente por la deriva ecológica, lo que ofrece ideas para el manejo de la acuicultura sin antibióticos.
Área de la Ciencia:
- Microbiología acuática
- Ecología larval
- Interacciones huésped-micróbio
Sus antecedentes:
- La microbiota intestinal juega un papel crucial en el desarrollo y la salud de los animales acuáticos.
- La comprensión de la dinámica microbiana durante las etapas larvales es vital para optimizar las prácticas acuícolas.
Objetivo del estudio:
- Investigar la dinámica específica de la etapa, los mecanismos de ensamblaje y las funciones funcionales de las comunidades bacterianas durante el desarrollo larval de Macrobrachium rosenbergii.
- Perfilar la microbiota de alta resolución y analizar la sucesión bacteriana, los taxones persistentes y los procesos ecológicos.
Principales métodos:
- Se empleó un muestreo de alta frecuencia (126 muestras) en 11 etapas zoológicas y 1 postlarval.
- Se utilizó la secuenciación de cuantificación absoluta de ARNr 16S, el modelado de abundancia-ocupación y el modelado de comunidad neutral.
- PICRUSt2 aplicado para la predicción funcional de las vías metabólicas.
Principales resultados:
- La abundancia bacteriana absoluta siguió una trayectoria trifásica con distintas fases de acumulación, expansión y remodelación.
- Ochenta variantes dominantes de la secuencia de amplicones (ASV), incluidas Herminiimonas y Maritalea, constituían más del 95% de la abundancia total.
- La construcción comunitaria estuvo dominada por la deriva ecológica, y las vías metabólicas cambiaron con los cambios en la dieta, lo que demuestra la sustitución filogenética de la resiliencia.
Conclusiones:
- Las comunidades bacterianas en las larvas de M. rosenbergii exhiben dinámicas complejas y específicas de la etapa impulsadas por la partición del nicho y la deriva ecológica.
- La resiliencia de la microbiota está respaldada por el reemplazo filogenético, lo que sugiere que la optimización de los entornos de acuicultura puede facilitar el manejo microbiano sin antibióticos.
- Este estudio mejora la comprensión de las interacciones huésped-microbio y la diferenciación de nicho ecológico en animales acuáticos.
Palabras clave:
Muestreo de alta frecuenciaMacrobrachium rosenbergii tambiéntecnología de secuenciación de cuantificación absolutaModelo de abundancia y ocupacióncomunidad bacterianacultivo de larvas
