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Updated: Sep 9, 2025

Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example
Published on: March 11, 2020
Introducción y distribución espacial y temporal del virus Oropouche en el estado de Río de Janeiro, Brasil
Fábio Burack da Costa1,2, Andrea Cony Cavalcanti2,3, Rafael Santos Erbisti4
1Laboratório das Interações Vírus-Hospedeiros-LIVH, Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz, Rio de Janeiro CEP 21040-360, RJ, Brazil.
Los brotes del virus Oropouche (OROV) están aumentando en Brasil. Este estudio confirma la circulación de OROV en Río de Janeiro, identificando una transmisión sostenida en la región de Paraíba Central y un nuevo linaje emergente.
Área de la Ciencia:
- Virología
- Epidemiología
- Salud pública
Sus antecedentes:
- El virus Oropouche (OROV) ha experimentado brotes crecientes en la región amazónica desde la década de 1960.
- El estado de Río de Janeiro informa un aumento en los casos de arbovirus, con muchas pruebas negativas para dengue, Zika y chikungunya.
Objetivo del estudio:
- Investigar retrospectivamente las infecciones por el virus Oropouche en casos sospechosos de dengue con diagnósticos no concluyentes en Río de Janeiro.
- Para entender la introducción temporal y geográfica de OROV en el estado.
Principales métodos:
- Análisis retrospectivo de los casos de arbovirus en el estado de Río de Janeiro.
- Pruebas de RT-PCR en tiempo real para OROV en muestras de pacientes con diagnósticos de arbovirus no concluyentes.
- Secuenciación del genoma de ocho cepas de OROV.
Principales resultados:
- La circulación del virus Oropouche (OROV) se confirmó en el estado de Río de Janeiro en abril de 2024.
- Se registraron 118 casos de OROV entre marzo y julio de 2024, principalmente en la región de Paraíba Central.
- La secuenciación del genoma reveló que OROV pertenece al linaje emergente M1L2S2, con una transmisión sostenida identificada en la región de Paraíba Central.
Conclusiones:
- La región de Paraíba Central es la primera área con transmisión sostenida del virus Oropouche (OROV) en el estado de Río de Janeiro.
- Este estudio pone de relieve la importancia de considerar el OROV en la vigilancia de los arbovirus, especialmente en regiones con diagnósticos no concluyentes.
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