El aprendizaje automático identifica el PYGM como un biomarcador metabólico vinculado a la polarización de los...

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• Inmunología
• El metabolismo

Sus antecedentes:

• La polarización de los macrófagos influye críticamente en el microambiente y la progresión del cáncer de recto.
• Los reguladores metabólicos y pronósticos de la polarización de los macrófagos en el cáncer rectal no se conocen bien.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar una firma genética de polarización de macrófagos (MPGS) para la evaluación del pronóstico en el cáncer rectal.
• Investigar el papel del gen hub PYGM en la biología del cáncer rectal y la modulación inmune.

Principales métodos:

• Se construyó MPGS utilizando WGCNA y aprendizaje automático en cohortes de cáncer rectal TCGA y GSE87211.
• Evaluación del pronóstico de la MPGS en varios tipos de cáncer.
• Se realizaron análisis funcionales, secuenciación de ARN de una sola célula, IHC y ensayos in vitro para estudiar el PYGM.

Principales resultados:

• El MPGS demostró una fuerte capacidad de pronóstico y predijo la respuesta a la inmunoterapia/ quimioterapia.
• MPGS y PYGM se correlacionaron con la infiltración de macrófagos M2, inmunosupresión y malos resultados en el adenocarcinoma rectal.
• El aumento de PYGM en las células malignas se relacionó con la actividad metabólica y la interacción de los macrófagos M2; el PYGM promovió la proliferación, la migración y la polarización de M2.

Conclusiones:

• El PYGM se identifica como un regulador metabólico e inmunológico crucial en el cáncer de recto con importancia pronóstica y terapéutica.
• El MPGS y el PYGM pueden servir como nuevos biomarcadores para la estratificación del riesgo.
• Estos hallazgos pueden orientar estrategias de tratamiento personalizadas para el adenocarcinoma rectal.