Phasing Hyb-Seq loci de dos conjuntos de cebo combinados para investigar los patrones filogenéticos de hibridación...

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva de las plantas
• La genómica
• Filogenética

Sus antecedentes:

• El género Boechera (Brassicaceae) exhibe hibridación compleja y apomixis, con más de 80 especies sexuales principalmente en América del Norte.
• Boechera es un sistema modelo clave para el estudio de la apomixis debido a su capacidad para formar híbridos apomíticos.

Objetivo del estudio:

• Mejorar el marco filogenético de Boechera mediante la incorporación de taxones apomíticos por fases.
• Para refinar la comprensión de la taxonomía de Boechera y la historia evolutiva.
• Para mostrar la utilidad de la fase de múltiples conjuntos de cebo Hyb-Seq para el estudio de la hibridación.

Principales métodos:

• HybPhaser modificado utilizado para la fase 1114 de los loci Hyb-Seq de dos conjuntos de cebo (específicos de Angiospermas353 y Brassicaceae).
• Se clasificaron siete híbridos diploides apomíticos basados en la morfología del polen y los datos de microsatélites.
• Las filogenias se construyeron utilizando RAxML-NG y wASTRAL.

Principales resultados:

• Phased con éxito los siete híbridos diploides putativos a través de 1114 loci.
• Incorporó 14 puntas híbridas en fases en una filogenia existente de diploides sexuales.
• Los resultados apoyan firmemente las relaciones híbridas previamente hipotéticas.

Conclusiones:

• Las puntas híbridas en fases integradas en la filogenia de Boechera revelan una intrincada historia evolutiva.
• Demostró la utilidad de la fase de múltiples conjuntos de cebo Hyb-Seq para explorar la hibridación.
• Destacó el papel importante de la hibridación y la apomixis en la configuración de la biodiversidad vegetal.