Integración de serotipos, MLST y datos fenotípicos: decodificación de los factores evolutivos de la patogenicidad y...

Área de la Ciencia:

• Microbiología y enfermedades infecciosas
• Genómica y biología evolutiva
• Seguridad alimentaria y salud pública

Sus antecedentes:

• La Salmonella enterica es un patógeno de transmisión alimentaria importante con una evolución compleja de la resistencia a los antimicrobianos y la patogenicidad.
• Los estudios anteriores carecían de análisis integrados de serotipos, MLST y datos fenotípicos para Salmonella.
• Comprender la estructura de la población y los factores evolutivos es crucial para el control de la salmonela.

Objetivo del estudio:

• Integrar la genómica y la fenómica para un análisis exhaustivo de la estructura de las poblaciones de Salmonella.
• Investigar la dinámica espacio-temporal y los factores evolutivos de la patogenicidad y la resistencia a los antimicrobianos en las salmonelas.
• Identificar los tipos de secuencias clave y los elementos genéticos asociados con la evolución y la resistencia de las salmonelas.

Principales métodos:

• Análisis de 935 aislamientos de Salmonella procedentes de fuentes clínicas y de la cadena alimentaria.
• La genómica integrada (serotipo, MLST) y la fenómica (perfiles de resistencia a los antimicrobianos).
• Seguimiento temporal (2018-2022) y análisis de redes para identificar agrupaciones evolutivas y factores determinantes.

Principales resultados:

• Salmonella Typhimurium y Salmonella Enteritidis fueron los serotipos dominantes; ST34 fue un tipo pivotal de MLST.
• Se observó un aumento significativo de la resistencia a la ciprofloxacina (15,3% a 30,4%) y una alta resistencia a la tetraciclina (77,3%).
• ST34 identificado como una columna vertebral genética para el cambio de serotipo; S. Typhimurium mostró la mayor carga genética y virulencia de AMR.

Conclusiones:

• La expansión clonal, la transferencia horizontal de genes y las ecologías regionales impulsan conjuntamente la evolución de Salmonella.
• La vigilancia integrada de genotipo y fenotipo es esencial para prevenir la aparición de resistencia y virulencia.
• Los hallazgos apoyan las intervenciones de "Una sola salud" para interrumpir la difusión de la resistencia antimicrobiana y mejorar los resultados de salud pública.