Métodos comparativos de concentración y extracción para la vigilancia basada en aguas residuales de ocho virus...

Área de la Ciencia:

• Microbiología ambiental
• Diagnóstico molecular
• Virología de la salud pública

Sus antecedentes:

• La vigilancia de las aguas residuales es crucial para la detección temprana de nuevos virus.
• La optimización de los métodos de concentración y extracción es vital para la detección sensible basada en la dPCR.
• La comprensión del rendimiento del método basado en las características del virus es necesaria para la preparación para una pandemia.

Objetivo del estudio:

• Evaluar la eficacia de cuatro métodos diferentes de concentración y extracción de aguas residuales para la detección viral basada en la dPCR.
• Evaluar cómo las características del virus influyen en el rendimiento del método.
• Determinar la utilidad de la normalización del indicador fecal para mejorar la consistencia de la detección.

Principales métodos:

• Contaminando muestras de aguas residuales con ocho virus respiratorios humanos.
• Procesamiento de muestras utilizando cuatro métodos distintos de concentración y extracción (Promega, Nanotrap, InnovaPrep y Sólidos).
• Analizar la eficiencia de la recuperación viral y normalizar los datos con los indicadores de PMMoV y Carjivirus.

Principales resultados:

• Los cuatro métodos, cuando se combinan con la dPCR, podrían detectar virus emergentes en las aguas residuales, pero con sensibilidades variables.
• El método Promega mostró mayores eficiencias de recuperación medianas para los adenovirus, los coronavirus y los virus de la influenza A.
• La normalización con indicadores fecales redujo las diferencias asociadas al método cuando los indicadores reflejaban los patrones de recuperación del virus objetivo.

Conclusiones:

• La elección del método de concentración y extracción tiene un impacto significativo en la sensibilidad de detección del virus en las aguas residuales.
• La normalización con indicadores fecales apropiados puede mejorar la fiabilidad de la detección de virus basados en aguas residuales.
• Estos hallazgos proporcionan orientación para seleccionar métodos óptimos en el monitoreo de aguas residuales, fortaleciendo la preparación para pandemias.