Un conjunto de genoma a nivel cromosómico de Omiodes indicata Fabricius (Lepidoptera: Crambidae)

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Ecología molecular
• Manejo de plagas

Sus antecedentes:

• Omiodes indicata es una plaga importante de las legumbres que amenaza la seguridad alimentaria en las regiones tropicales y subtropicales.
• Los datos genómicos limitados para O. indicata han obstaculizado la investigación ecológica y de gestión.

Objetivo del estudio:

• Para generar un ensamblaje de genoma de alta calidad para Omiodes indicata.
• Proporcionar un recurso fundamental para estudios de ecología molecular y manejo de plagas.

Principales métodos:

• Utilizó las tecnologías de lectura larga PacBio HiFi, lectura corta Illumina y secuenciación Hi-C.
• Realizó el ensamblaje del genoma y la predicción de genes.
• Evaluación de la integridad del genoma mediante análisis BUSCO.

Principales resultados:

• Se logró un ensamblaje de genoma de 493,08 Mb con 59 andamios (N50: 17,25 Mb), anclado a 31 cromosomas.
• La integridad del genoma fue alta (detección BUSCO del 99,1%), con 14.713 genes codificadores de proteínas predichos.
• Los elementos repetitivos representaron el 38.13% del genoma.

Conclusiones:

• El genoma de alta calidad de O. indicata es un recurso valioso para la ecología molecular.
• Estos datos genómicos avanzarán en el desarrollo de estrategias modernas de control de plagas para esta importante plaga de legumbres.