Explorando las complejidades de la microbiota intestinal y pulmonar en la fibrosis quística: un enfoque multi-ómico

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• Pulmonología

Sus antecedentes:

• La fibrosis quística (FQ) se caracteriza por infecciones y inflamaciones crónicas.
• Comprender la compleja interacción entre el huésped y la microbiota en la FQ es crucial para el desarrollo terapéutico.

Objetivo del estudio:

• Analizar exhaustivamente la composición y la función de la microbiota intestinal y pulmonar en pacientes con FQ.
• Investigar la relación entre las comunidades microbianas, los ácidos grasos de cadena corta (SCFA) y la función pulmonar en la FQ.

Principales métodos:

• La metagenómica de escopeta se empleó para perfilar las comunidades bacterianas, fúngicas y virales.
• Los ácidos grasos de cadena corta (SCFA) se cuantificaron para evaluar la función metabólica.
• Se recogieron muestras de heces y esputo de 39 individuos con FQ clínicamente estables.

Principales resultados:

• Los filos bacterianos dominantes incluían Bacillota y Pseudomonadota tanto en el intestino como en el pulmón.
• Los hongos variaron, con Ascomycota en las heces y Basidiomycota (Malassezia globosa) en el esputo.
• Se detectaron Mycobacteroides abscessus y Toxoplasma gondii; la presencia viral fue baja.
• No se encontró una correlación directa entre los niveles de SCFA y la función pulmonar o la composición microbiana.
• El resistoma intestinal fue más alto que el resistoma pulmonar; los SCFA intestinales se correlacionaron con una función pulmonar más pobre.

Conclusiones:

• La diversidad alfa de la microbiota respiratoria fue mayor en pacientes con una función pulmonar normal y leve.
• La diversidad beta de las heces difería significativamente entre los grupos con función pulmonar variable.
• Las bacterias productoras de butirato se enriquecieron en el esputo de individuos con mejor función pulmonar.
• Se observaron perfiles de resistencia distintos en muestras fecales (tetraciclinas, glicopéptidos, aminoglucósidos) y de esputo (tetraciclinas, beta-lactamas, macrólidos).