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Updated: Sep 9, 2025

Characterization of a Pathogenic Escherichia coli Strain Derived from Oreochromis spp. Farms Using Whole-Genome Sequencing
Published on: December 23, 2022
Epidemiología molecular y conocimientos genómicos sobre el complejo Enterobacter cloacae Co-Harboring blaKPC y mcr:
Boqian Wang1, Jingjing Fu2, Yaqing He3
1Laboratory of Advanced Biotechnology, Beijing Institute of Biotechnology, Beijing 100071, China.
Las cepas complejas de Enterobacter cloacae son reservorios para los genes blaKPC y mcr, a menudo ubicados en los plásmidos IncHI2 ((2A). Esto pone de relieve la necesidad de monitorear estos genes de resistencia a los medicamentos en entornos clínicos.
Área de la Ciencia:
- Epidemiología molecular
- Caracterización genómica
- Resistencia a los antimicrobianos
Sus antecedentes:
- Las cepas del complejo Enterobacter cloacae (ECC) son patógenos oportunistas significativos.
- La aparición de genes de resistencia al carbapenem (blaKPC) y a la colistina (mcr) representa una grave amenaza para la salud pública.
- La comprensión de la base molecular de la co-resistencia es crucial para las estrategias de tratamiento eficaces.
Objetivo del estudio:
- Investigar sistemáticamente la epidemiología molecular y las características genómicas de las cepas de ECC que albergan genes blaKPC y mcr.
- Analizar la coexistencia y el contexto genético de estos determinantes de la resistencia.
- Proporcionar información para el seguimiento y el control de la propagación de la ECC multirresistente.
Principales métodos:
- Análisis de 281 aislamientos de ECC con datos de secuenciación de todo el genoma de la base de datos NCBI GenBank (2003-2024).
- Análisis filogenético de cepas ECC para comprender las relaciones evolutivas.
- Identificación y análisis de la distribución de los genes de resistencia utilizando las bases de datos ABRicate y CARD.
- Tipo de réplica de plásmido y análisis de los entornos genéticos que rodean los genes blaKPC y mcr utilizando PlasmidFinder.
Principales resultados:
- La combinación genotípica predominante fue blaKPC-3 y mcr-9.1, frecuentemente encontrada en E. hormaechei ssp. Es una xiangfangensis.
- El plásmido IncHI2 ((2A) que contiene blaKPC y mcr-9 se detectó principalmente en aislamientos de los Estados Unidos.
- El análisis filogenético sugiere que los plásmidos IncHI2(2A) portadores de mcr-9 pueden haber adquirido blaKPC, lo que facilita la co-transmisión.
Conclusiones:
- Las cepas ECC sirven como reservorios importantes para la diseminación conjunta de blaKPC y mcr-9.
- El plásmido IncHI2 ((2A) actúa como un vehículo potencial para la transferencia horizontal de la resistencia al carbapenem y a la colistina.
- Es esencial una vigilancia eficaz para controlar la prevalencia de los aislados y plásmidos de ECC que contienen blaKPC y mcr-9.
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