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Updated: Sep 9, 2025
09:59
In Vivo Application of TurboID-based Proximity Labeling in Drosophila melanogaster
Published on: June 13, 2025
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Identificación con silicio-rodamina para el etiquetado de proximidad controlado por luz infrarroja cercana in vitro e
Wenjing Wang1,2, Hongyang Guo2, Xiaosa Yan3
1Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing, China.
Nature communications
|August 30, 2025
Resumen
Los investigadores desarrollaron SeeID, un nuevo método que utiliza silicio-rodamina (SiR) para el etiquetado de proximidad controlado por luz. Esta técnica une las imágenes de fluorescencia y la proteómica, lo que permite estudios dinámicos de interactomas de proteínas en células y cerebros de ratones vivos.
Área de la Ciencia:
- La bioquímica
- Biología molecular
- Biología celular
Sus antecedentes:
- Las imágenes de fluorescencia ofrecen una alta resolución espacio-temporal para la dinámica de las proteínas, pero no pueden revelar las interacciones de las proteínas.
- Los métodos proteómicos como el etiquetado de proximidad analizan los interactomas de proteínas en puntos de tiempo únicos, sin información dinámica.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar la identificación habilitada con silicio-rodamina (SeeID), una nueva técnica para el etiquetado de proximidad controlado por luz infrarroja cercana.
- Para cerrar la brecha entre las imágenes dinámicas y la proteómica estática, permitiendo el análisis de interactomas con resolución espacio-temporal.
Principales métodos:
- Se desarrolló SeeID utilizando la naturaleza fluorogénica de la silicio-rodamina (SiR) como fluoroforo y fotocatalizador.
- Se comparó SeeID a través de la caracterización de los proteomas específicos de los orgánulos y el interactoma de la proteína KRAS.
- Se aplicó SeeID para estudiar los interactomas de proteínas dinámicas de Parkin durante la mitofagia y en la corteza cerebral del ratón in vivo.
Principales resultados:
- SeeID logró una alta especificidad subcelular para el etiquetado de proximidad intracelular.
- Descubrió la asociación del complejo proteasómico con Parkin al principio de la mitofagia, lo que sugiere la participación del sistema ubiquitina-proteasómico.
- Se ha demostrado el etiquetado de proximidad in vivo controlado espacialmente en la corteza cerebral del ratón hasta una profundidad de ~ 2 mm utilizando luz infrarroja cercana.
Conclusiones:
- SeeID une con éxito las imágenes de fluorescencia y el etiquetado de proximidad, lo que permite estudios dinámicos de interactomas.
- El método proporciona información sobre los mecanismos tempranos de la mitofagia y la degradación de las proteínas.
- SeeID ofrece una poderosa herramienta para el análisis proteómico in vivo de tejidos profundos con control espacio-temporal.
