Análisis de asociación basado en la secuencia del genoma completo de individuos afroamericanos con trastorno bipolar...

Área de la Ciencia:

• La genética
• Trastornos psiquiátricos
• Medicina genómica

Sus antecedentes:

• Los estudios previos sobre las variantes de riesgo de trastorno bipolar y esquizofrenia se centraron principalmente en la ascendencia europea.
• Existen conocimientos limitados sobre los factores de riesgo genéticos en poblaciones no europeas, en particular sobre las variantes no codificantes raras.

Objetivo del estudio:

• Investigar los datos de secuenciación del genoma completo de individuos afroamericanos para identificar las variantes genéticas asociadas con el riesgo de BD y SZ.
• Explorar el papel de las variantes no codificantes raras en la arquitectura genética de BD y SZ en esta población.

Principales métodos:

• Se realizó la secuenciación del genoma completo en 1.598 individuos con BD, 3.295 con SZ y 2.651 controles (estudio InPSYght).
• Se incluyeron controles adicionales (14,812) del Programa Trans-Omics para la Medicina de Precisión (TOPMed) para aumentar el poder estadístico.
• Los análisis incluyeron pruebas de una sola variante, pruebas basadas en genes para variantes de truncamiento de proteínas y pruebas basadas en anotaciones para variantes raras/de baja frecuencia utilizando estados de conservación y cromatina.

Principales resultados:

• Evidencia sugerente para la asociación de BD con variantes únicas en el cromosoma 18.
• Asociación de variantes raras/de baja frecuencia en el cromosoma 11 con menor riesgo de BD, localizadas cerca de los loci conocidos del estudio de asociación de todo el genoma de BD (GWAS).
• Utilidad demostrada de los ensayos de cromatina y estado de conservación para el control de la calidad de las llamadas variantes y el ajuste de las covariantes.

Conclusiones:

• Los hallazgos destacan la importancia de la secuenciación del genoma completo en diversas poblaciones, específicamente en afroamericanos, para comprender el riesgo genético de BD y SZ.
• Hace hincapié en la necesidad de una completa anotación funcional de las variantes no codificantes para dilucidar completamente su papel en los trastornos psiquiátricos.
• Sugiere posibles loci genéticos en los cromosomas 11 y 18 que garantizan una mayor investigación en las poblaciones afroamericanas.