Ensamblaje del genoma a escala cromosómica de Helcystogramma triannulella (Lepidoptera: Gelechiidae)

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Entomología agrícola
• Manejo de plagas

Sus antecedentes:

• Helcystogramma triannulella es una plaga destructiva de los cultivos de las Convolvulaceae, que causa pérdidas económicas sustanciales.
• Los recursos genómicos limitados dificultan la comprensión de la biología de H. triannulella y las estrategias efectivas de control de plagas.

Objetivo del estudio:

• Para generar el primer conjunto de genoma a escala cromosómica para Helcystogramma triannulella.
• Proporcionar un valioso recurso genómico para la investigación y el control de plagas.

Principales métodos:

• Se emplearon tecnologías de secuenciación PacBio HiFi y Hi-C.
• El montaje a escala de cromosomas se logró a través de andamios asistidos por Hi-C.
• Se anotaron los genes codificadores de proteínas y los elementos repetitivos.

Principales resultados:

• Se produjo un ensamblaje de genoma de 387,28 Mb con una alta contiguidad (contig N50: 2,28 Mb, andamio N50: 12,75 Mb).
• El 91,77% del conjunto estaba anclado a 30 cromosomas.
• El ensamblaje es altamente completo (BUSCO: 96.2%) y contiene 14.211 genes codificadores de proteínas anotados, con 49.02% identificados como elementos repetitivos.

Conclusiones:

• El ensamblaje del genoma a escala cromosómica de H. triannulella es un avance significativo.
• Este recurso genómico facilitará la investigación futura en biología de plagas y el desarrollo de estrategias específicas de control de plagas.