Una introducción a la secuenciación y la imputación del genotipo en el ganado

Área de la Ciencia:

• Genómica de los animales
• Biotecnología agrícola
• Genética de las poblaciones

Sus antecedentes:

• Las tecnologías de genotipo han revolucionado la industria de la carne, permitiendo la selección genómica.
• Las matrices de polimorfismo de nucleótido único (SNP) han sido centrales en los programas de selección genómica.
• Los avances en la secuenciación y la imputación presentan alternativas rentables a las matrices.

Objetivo del estudio:

• Revisar el genotipado basado en matrices, la secuenciación genómica y la secuenciación de paso bajo con imputación.
• Explorar el potencial de la secuenciación e imputación de baja cobertura para el descubrimiento genómico y el genotipado de rutina.

Principales métodos:

• Visión general de las tecnologías actuales de genotipo.
• Discusión de las metodologías de secuenciación e imputación.
• Análisis de la rentabilidad y del rendimiento de la información.

Principales resultados:

• La secuenciación y la imputación ofrecen significativamente más datos que las matrices a un costo más bajo.
• La secuenciación de baja cobertura combinada con la imputación es un enfoque prometedor.
• La disminución de los costos de secuenciación mejora la viabilidad de estos métodos avanzados.

Conclusiones:

• La secuenciación e imputación de baja cobertura puede impulsar el descubrimiento genómico en poblaciones de carne.
• Estos métodos están a punto de convertirse en el estándar para la genotipización de rutina.
• Los avances tecnológicos prometen una mejora genética acelerada en el ganado.