Diagnóstico de genes relacionados con la panoptosis en lesiones renales agudas: bioinformática, aprendizaje...

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Inmunología
• La genética

Sus antecedentes:

• La lesión renal aguda (IRA) es una condición crítica que implica la pérdida rápida de la función renal y la inflamación.
• La PANóptosis, una forma de muerte celular programada, contribuye significativamente al desarrollo y la progresión de AKI.
• Comprender el papel de los genes relacionados con la PANoptosis es crucial para la investigación de AKI.

Objetivo del estudio:

• Investigar el potencial diagnóstico y terapéutico de los genes relacionados con la PANoptosis en la IAC.
• Identificar los genes clave de PANoptosis asociados con la fisiopatología de AKI.
• Para explorar la relación entre los genes de PANoptosis, la infiltración de células inmunes y los posibles objetivos farmacológicos en AKI.

Principales métodos:

• Se analizaron los datos transcriptómicos de las biopsias renales para identificar los genes expresados diferencialmente (DEG) relacionados con la PANóptosis en AKI.
• El análisis de la red de correlación génica ponderada (WGCNA) se utilizó para identificar los genes centrales.
• El análisis de enriquecimiento del conjunto de genes de una sola muestra (ssGSEA) calculó las puntuaciones de PANoptosis y la infiltración de células inmunes.
• Los algoritmos de aprendizaje automático y el análisis de ROC seleccionaron genes de características diagnósticas, y se investigaron las interacciones entre fármacos y genes.

Principales resultados:

• Se identificaron 3460 DEGs relacionados con la PANoptosis, enriquecidos en las vías de señalización de citoquinas y apoptosis.
• Se identificaron ocho genes de PANoptosis de núcleo, con puntuaciones de PANoptosis significativamente más altas en pacientes con AKI.
• CASP8, CASP4, SFN, FAS y CASP1 fueron seleccionados como marcadores diagnósticos clave, con CASP8 mostrando un alto valor predictivo (AUC=0,850).
• Estos genes se correlacionaron con la infiltración de células inmunes y mostraron posibles asociaciones farmacológicas, validadas en un modelo de rata.

Conclusiones:

• Los genes relacionados con la PANoptosis sirven como biomarcadores diagnósticos prometedores para el AKI.
• Estos genes representan objetivos terapéuticos potenciales para el tratamiento de AKI.
• Los hallazgos subrayan el papel de la PANoptosis en la desregulación inmune asociada a la IAC.