La apertura y cierre de un bolsillo críptico en VP35 lo cambia entre dos modos de unión de ARN diferentes

Área de la Ciencia:

• Biología estructural
• Virología
• Descubrimiento de drogas

Sus antecedentes:

• Las bolsas crípticas son objetivos potenciales de drogas para las interacciones proteína-ácido nucleico.
• Su importancia funcional y el potencial para la evolución de la resistencia a los medicamentos no están claros.

Objetivo del estudio:

• Investigar si una bolsa críptica en la proteína viral 35 (VP35) del ébolavirus de Zaire ayuda a la unión del ARN de doble cadena (dsRNA).
• Explorar el papel de la apertura de bolsillo críptico en la unión de dsRNA a través de diferentes homólogos de filovirus.

Principales métodos:

• Simulaciones moleculares
• Experimentos de etiquetado con tiol
• Pruebas de unión al dsRNA
• Análisis de mutación puntual

Principales resultados:

• Los dominios inhibidores del interferón filoviral (IID) muestran probabilidades variables de apertura de la bolsa críptica.
• Las conformaciones de bolsillo cerrado se unen preferentemente a los extremos contundentes del dsRNA.
• Las conformaciones de bolsillo abierto se unen preferentemente a la columna vertebral del dsRNA.

Conclusiones:

• El bolsillo críptico en VP35 es funcional e influye en la unión de dsRNA.
• Las bolsas crípticas están probablemente bajo presión selectiva y pueden ser resistentes a la evolución de la resistencia a los medicamentos.