Los genomas del virus del papiloma humano se asocian con la cromatina activa del huésped durante la infección viral...

Área de la Ciencia:

• Virología
• La epigenética
• Biología del cáncer

Sus antecedentes:

• Los papilomavirus humanos (HPV) establecen infecciones persistentes al mantener sus genomas como minicromosomas dentro de los núcleos de los queratinocitos huésped.
• Comprender la interacción entre los genomas virales y la cromatina del huésped es crucial para dilucidar la persistencia viral y la oncogénesis.

Objetivo del estudio:

• Investigar la asociación de los genomas HPV31 con las estructuras de la cromatina del huésped.
• Para correlacionar los sitios de asociación del genoma viral con la actividad transcripcional del huésped y la susceptibilidad a la ruptura del ADN.
• Explorar las implicaciones para la expresión génica viral y el desarrollo de cáncer asociado al VPH.

Principales métodos:

• Se emplearon técnicas de captura de conformación cromosómica, específicamente HiC y 4C-seq, para mapear las interacciones del genoma HPV31 con la cromatina del huésped.
• Datos integrados de ATAC-seq (cromatina abierta) y ChIP-seq (Brd4, H3K27ac para superpotenciadores) para definir las características de la cromatina del huésped.
• Se analizaron las correlaciones con los conjuntos de datos de ruptura de ADN (dsBREAK) y los sitios conocidos de integración de VPH en los cánceres cervicales.

Principales resultados:

• Los genomas HPV31 se asocian preferentemente con compartimentos A transcripcionalmente activos, regiones de cromatina abiertas (ATAC-seq) y superpotenciadores (Brd4, H3K27ac).
• Los sitios de asociación del genoma viral se correlacionan fuertemente con los sitios de integración comunes del VPH que se encuentran en los cánceres cervicales.
• Existe una correlación significativa entre los sitios de asociación del genoma HPV31, la cromatina transcripcionalmente activa / abierta y las rupturas de dsDNA.

Conclusiones:

• Los genomas del VPH se asocian con los epicentros transcripcionales celulares del huésped para mantener la expresión genética viral activa durante la infección persistente.
• La susceptibilidad de estas regiones activas de la cromatina a las rupturas de dsDNA probablemente explica la propensión a la integración del ADN viral en los cánceres asociados al VPH.